More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6029 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  100 
 
 		 712 aa  1456    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  55.46 
 
 		 716 aa  791    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 		 857 aa  323  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  35.48 
 
 		 737 aa  322  9.999999999999999e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  37.18 
 
 		 869 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  35.68 
 
 		 739 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  35.24 
 
 		 874 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  35.24 
 
 		 874 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  35.24 
 
 		 874 aa  310  9e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  35.24 
 
 		 874 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  35.24 
 
 		 874 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  38.45 
 
 		 845 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  37.78 
 
 		 855 aa  308  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.26 
 
 		 845 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  37.5 
 
 		 869 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  33.81 
 
 		 872 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.81 
 
 		 872 aa  306  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  33.81 
 
 		 872 aa  306  7e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  33.81 
 
 		 872 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  33.81 
 
 		 872 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  33.81 
 
 		 872 aa  306  9.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  33.81 
 
 		 872 aa  306  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  34.35 
 
 		 872 aa  305  2.0000000000000002e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  37.89 
 
 		 845 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.82 
 
 		 845 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.51 
 
 		 851 aa  304  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  38.82 
 
 		 845 aa  303  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  38.82 
 
 		 845 aa  303  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  37.13 
 
 		 869 aa  302  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.64 
 
 		 845 aa  301  2e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  36.46 
 
 		 899 aa  300  8e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  37.92 
 
 		 1455 aa  299  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  33.45 
 
 		 872 aa  299  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  35.99 
 
 		 867 aa  298  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.87 
 
 		 702 aa  296  9e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.25 
 
 		 848 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.25 
 
 		 848 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.25 
 
 		 846 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  38.25 
 
 		 846 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.25 
 
 		 848 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  39.06 
 
 		 846 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.09 
 
 		 743 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  36.92 
 
 		 699 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.06 
 
 		 734 aa  292  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  33.78 
 
 		 734 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.1 
 
 		 696 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  34.9 
 
 		 899 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  38.22 
 
 		 848 aa  291  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  34.24 
 
 		 872 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  32.65 
 
 		 741 aa  278  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  35.79 
 
 		 726 aa  270  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  34.18 
 
 		 718 aa  270  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.38 
 
 		 730 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  38.81 
 
 		 1129 aa  265  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.7 
 
 		 730 aa  259  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  36.72 
 
 		 749 aa  255  2.0000000000000002e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  36.36 
 
 		 768 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  30.86 
 
 		 740 aa  253  1e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  39.31 
 
 		 1140 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  33.52 
 
 		 729 aa  251  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  38.58 
 
 		 778 aa  251  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.59 
 
 		 831 aa  250  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  35.06 
 
 		 909 aa  250  7e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.59 
 
 		 834 aa  249  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  38.82 
 
 		 1140 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  36.24 
 
 		 1140 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.11 
 
 		 811 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  36.2 
 
 		 788 aa  248  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.64 
 
 		 810 aa  248  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  35.77 
 
 		 788 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.39 
 
 		 822 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  39.04 
 
 		 664 aa  247  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  35.77 
 
 		 788 aa  247  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  37.47 
 
 		 664 aa  246  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 591 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.71 
 
 		 804 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  35.86 
 
 		 773 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 		 773 aa  238  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  38.98 
 
 		 672 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  43.25 
 
 		 672 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  39.83 
 
 		 666 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  42.91 
 
 		 672 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 		 658 aa  234  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.19 
 
 		 930 aa  234  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  42.01 
 
 		 661 aa  231  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.78 
 
 		 794 aa  230  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  30.76 
 
 		 707 aa  226  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  41.39 
 
 		 620 aa  226  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  34.29 
 
 		 544 aa  226  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  31.49 
 
 		 758 aa  225  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.78 
 
 		 657 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  34.78 
 
 		 655 aa  224  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.78 
 
 		 657 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  34.78 
 
 		 655 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  33.54 
 
 		 659 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  34.78 
 
 		 657 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  34.78 
 
 		 655 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  34.78 
 
 		 655 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  34.03 
 
 		 501 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  37.36 
 
 		 658 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0354405 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>