More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1164 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  100 
 
 		 652 aa  1315    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  55.88 
 
 		 659 aa  745    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  59.42 
 
 		 658 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  95.4 
 
 		 652 aa  1229    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  99.39 
 
 		 652 aa  1307    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  47.79 
 
 		 658 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  47.64 
 
 		 1135 aa  546  1e-154  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  49.05 
 
 		 659 aa  548  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.33 
 
 		 657 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  48.17 
 
 		 655 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  48.33 
 
 		 655 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.33 
 
 		 657 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  48.17 
 
 		 655 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  48.17 
 
 		 655 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  48.17 
 
 		 657 aa  533  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  39.86 
 
 		 664 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  37.3 
 
 		 664 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  36.01 
 
 		 672 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  36.65 
 
 		 661 aa  360  5e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  35.73 
 
 		 672 aa  360  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  35.73 
 
 		 672 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  36.68 
 
 		 666 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  34.2 
 
 		 737 aa  300  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.01 
 
 		 768 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.05 
 
 		 718 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  32.32 
 
 		 683 aa  258  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  34.12 
 
 		 749 aa  257  5e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  35.19 
 
 		 773 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 		 773 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  29.54 
 
 		 740 aa  229  9e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  27.94 
 
 		 741 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  30.73 
 
 		 869 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  36.17 
 
 		 712 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  29.84 
 
 		 729 aa  210  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  32.14 
 
 		 739 aa  210  6e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  29.59 
 
 		 726 aa  209  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.36 
 
 		 702 aa  209  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.21 
 
 		 696 aa  208  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.02 
 
 		 930 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 857 aa  207  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.02 
 
 		 804 aa  206  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  30.2 
 
 		 869 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.55 
 
 		 743 aa  206  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  30.35 
 
 		 788 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  30.56 
 
 		 788 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.51 
 
 		 811 aa  205  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.26 
 
 		 834 aa  204  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  34.12 
 
 		 716 aa  204  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.98 
 
 		 822 aa  203  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  30.07 
 
 		 869 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.07 
 
 		 831 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.56 
 
 		 810 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  29.01 
 
 		 788 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.33 
 
 		 730 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  32.08 
 
 		 758 aa  200  5e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  31.05 
 
 		 909 aa  200  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  31.05 
 
 		 734 aa  199  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.96 
 
 		 730 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.36 
 
 		 734 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.64 
 
 		 845 aa  198  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  27.34 
 
 		 874 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  27.34 
 
 		 874 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  27.34 
 
 		 874 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  27.34 
 
 		 874 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  28.6 
 
 		 899 aa  197  5.000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  27.34 
 
 		 874 aa  197  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  30 
 
 		 845 aa  197  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 		 1140 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.06 
 
 		 846 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 1129 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.37 
 
 		 794 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  30.19 
 
 		 699 aa  195  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.38 
 
 		 848 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  29.76 
 
 		 846 aa  196  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.38 
 
 		 848 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.38 
 
 		 848 aa  196  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  30.51 
 
 		 845 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  30.51 
 
 		 845 aa  194  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  31.72 
 
 		 1140 aa  194  5e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.27 
 
 		 846 aa  194  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  31.43 
 
 		 778 aa  193  9e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  26.55 
 
 		 872 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.55 
 
 		 872 aa  192  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  26.55 
 
 		 872 aa  193  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  26.55 
 
 		 872 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  26.55 
 
 		 872 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  26.75 
 
 		 872 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  26.55 
 
 		 872 aa  192  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  29.81 
 
 		 845 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 1140 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  29.48 
 
 		 867 aa  191  5e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.09 
 
 		 845 aa  191  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.33 
 
 		 845 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  28.29 
 
 		 855 aa  190  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  27.33 
 
 		 899 aa  190  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  29.35 
 
 		 848 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  26 
 
 		 872 aa  189  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  26.32 
 
 		 872 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31 
 
 		 851 aa  185  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  31.35 
 
 		 1455 aa  185  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>