More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1338 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 772 aa  1524    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 		 868 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 		 859 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  40.18 
 
 		 885 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 		 903 aa  305  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  36.63 
 
 		 863 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  36.74 
 
 		 863 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 		 863 aa  301  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  39.2 
 
 		 863 aa  300  6e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  36.95 
 
 		 917 aa  300  6e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  36.26 
 
 		 862 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  37.89 
 
 		 869 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  37.42 
 
 		 831 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  35.45 
 
 		 944 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  33.21 
 
 		 895 aa  253  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  35 
 
 		 889 aa  252  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.16 
 
 		 842 aa  250  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  35.01 
 
 		 889 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 919 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 899 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  36.93 
 
 		 905 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 		 844 aa  240  8e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  34.48 
 
 		 895 aa  240  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 610 aa  239  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  31.32 
 
 		 889 aa  234  5e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  30.14 
 
 		 716 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  31.89 
 
 		 778 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  33.44 
 
 		 652 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  30.14 
 
 		 740 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  28.2 
 
 		 749 aa  131  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  27.81 
 
 		 712 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.12 
 
 		 652 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  26.71 
 
 		 564 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.1 
 
 		 930 aa  125  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  31.33 
 
 		 726 aa  123  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 514 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.76 
 
 		 652 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  28.9 
 
 		 788 aa  122  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.73 
 
 		 810 aa  120  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.96 
 
 		 804 aa  120  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.36 
 
 		 768 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  27.81 
 
 		 788 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  27.81 
 
 		 788 aa  115  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.04 
 
 		 811 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.17 
 
 		 822 aa  115  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.96 
 
 		 794 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  27.52 
 
 		 729 aa  113  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 1140 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  29.9 
 
 		 658 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.01 
 
 		 831 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.01 
 
 		 834 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 1140 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.15 
 
 		 730 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.47 
 
 		 730 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 1140 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  29.4 
 
 		 666 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  26.76 
 
 		 501 aa  110  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 579 aa  108  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  30.15 
 
 		 672 aa  108  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.04 
 
 		 586 aa  108  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.15 
 
 		 672 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.15 
 
 		 672 aa  108  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 		 657 aa  108  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 		 657 aa  107  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  28.83 
 
 		 655 aa  107  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.44 
 
 		 1135 aa  107  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  26.44 
 
 		 899 aa  107  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  28.83 
 
 		 655 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  27.43 
 
 		 683 aa  107  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  28.83 
 
 		 655 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  28.83 
 
 		 657 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  28.83 
 
 		 655 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  24.3 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.98 
 
 		 702 aa  106  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 591 aa  106  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 		 505 aa  106  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  28.46 
 
 		 869 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.2 
 
 		 664 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  25.79 
 
 		 899 aa  105  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  26.38 
 
 		 867 aa  104  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 		 658 aa  104  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  28.77 
 
 		 659 aa  103  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  28.02 
 
 		 737 aa  102  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  25.72 
 
 		 707 aa  102  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  28.19 
 
 		 869 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  28.89 
 
 		 661 aa  102  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  28.04 
 
 		 699 aa  101  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.41 
 
 		 503 aa  101  6e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 659 aa  101  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  28.89 
 
 		 664 aa  100  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.79 
 
 		 696 aa  100  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.3 
 
 		 544 aa  100  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.78 
 
 		 1101 aa  99.4  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 620 aa  99.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  26.64 
 
 		 758 aa  99.8  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.17 
 
 		 773 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  27.75 
 
 		 869 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.32 
 
 		 980 aa  98.6  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  25.32 
 
 		 741 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 533 aa  97.8  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>