More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0560 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  44.88 
 
 		 863 aa  756    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  42.44 
 
 		 868 aa  681    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  44.76 
 
 		 862 aa  753    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  44.48 
 
 		 863 aa  733    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  44.65 
 
 		 863 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  43.5 
 
 		 885 aa  737    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  44.1 
 
 		 903 aa  725    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  40.27 
 
 		 859 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 		 863 aa  758    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 917 aa  1874    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  43.88 
 
 		 869 aa  731    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.56 
 
 		 842 aa  597  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 		 831 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  37.97 
 
 		 889 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  37.57 
 
 		 919 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 		 889 aa  542  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  38.03 
 
 		 895 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  37.33 
 
 		 899 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  37.82 
 
 		 895 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  35.12 
 
 		 944 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  36.6 
 
 		 844 aa  512  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 889 aa  511  1e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 		 905 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 		 772 aa  298  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 610 aa  224  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  38.16 
 
 		 529 aa  217  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  36.78 
 
 		 541 aa  198  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  33.61 
 
 		 531 aa  198  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  31.96 
 
 		 536 aa  197  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  34.12 
 
 		 558 aa  196  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  33.07 
 
 		 558 aa  194  7e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  39.51 
 
 		 540 aa  194  9e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  32.49 
 
 		 541 aa  193  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  35.88 
 
 		 533 aa  193  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  36.63 
 
 		 650 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  33.99 
 
 		 538 aa  190  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  32.25 
 
 		 494 aa  188  4e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  34.91 
 
 		 535 aa  187  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  36.98 
 
 		 522 aa  187  9e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  37.58 
 
 		 521 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  36.84 
 
 		 525 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  32 
 
 		 638 aa  178  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  31.65 
 
 		 532 aa  177  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  28.87 
 
 		 652 aa  147  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.1 
 
 		 652 aa  146  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 		 295 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  28.77 
 
 		 716 aa  144  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  31.93 
 
 		 295 aa  144  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.34 
 
 		 652 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  30.86 
 
 		 740 aa  134  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  28.44 
 
 		 501 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 514 aa  128  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  33.45 
 
 		 749 aa  125  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.51 
 
 		 768 aa  124  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  31.05 
 
 		 712 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 		 658 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.01 
 
 		 544 aa  121  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  27.6 
 
 		 659 aa  120  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  28.53 
 
 		 666 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  27.92 
 
 		 739 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 650 aa  115  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3677  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 		 579 aa  114  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.846949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.35 
 
 		 672 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  27.51 
 
 		 672 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  28.27 
 
 		 655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  31.35 
 
 		 729 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.27 
 
 		 657 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.27 
 
 		 657 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  28.92 
 
 		 737 aa  113  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 		 857 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 		 620 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.22 
 
 		 672 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  28.27 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  28.27 
 
 		 655 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  28.27 
 
 		 655 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  28.27 
 
 		 655 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 		 546 aa  111  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  23.08 
 
 		 741 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.5 
 
 		 503 aa  110  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.03 
 
 		 804 aa  110  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  26.01 
 
 		 855 aa  108  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.41 
 
 		 811 aa  108  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  29.72 
 
 		 658 aa  107  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.63 
 
 		 980 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.05 
 
 		 773 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 		 659 aa  106  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.77 
 
 		 851 aa  106  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.29 
 
 		 702 aa  105  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 		 773 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 533 aa  105  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  30 
 
 		 586 aa  105  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  26.56 
 
 		 661 aa  104  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.62 
 
 		 846 aa  104  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.72 
 
 		 1135 aa  104  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  28.04 
 
 		 564 aa  104  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  28.82 
 
 		 778 aa  104  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.47 
 
 		 664 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.78 
 
 		 930 aa  103  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.01 
 
 		 696 aa  104  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>