58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2602 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  69.66 
 
 		 538 aa  774    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  100 
 
 		 541 aa  1087    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  73.52 
 
 		 558 aa  805    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  75.19 
 
 		 558 aa  825    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  75.1 
 
 		 494 aa  748    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  73.96 
 
 		 532 aa  822    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  72.01 
 
 		 536 aa  783    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  47.3 
 
 		 541 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  42.92 
 
 		 540 aa  307  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  39.81 
 
 		 531 aa  307  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  40.2 
 
 		 522 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  39.18 
 
 		 521 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  42.09 
 
 		 521 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  41.86 
 
 		 525 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  42.57 
 
 		 533 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  36.21 
 
 		 638 aa  286  9e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  35.29 
 
 		 535 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  35.93 
 
 		 650 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  34.66 
 
 		 529 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  34.29 
 
 		 844 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  36.39 
 
 		 869 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 		 903 aa  200  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  39.87 
 
 		 895 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 		 919 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 889 aa  193  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  38.91 
 
 		 905 aa  193  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  38.51 
 
 		 889 aa  192  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  37.57 
 
 		 899 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  39.3 
 
 		 895 aa  189  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 		 917 aa  186  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  32.47 
 
 		 863 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 		 863 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 		 862 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 863 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 		 885 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 		 889 aa  179  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  35.1 
 
 		 944 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  36.3 
 
 		 863 aa  171  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  34.97 
 
 		 868 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 		 859 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.22 
 
 		 842 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  33.84 
 
 		 831 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  31.11 
 
 		 295 aa  137  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  31.11 
 
 		 295 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  29.32 
 
 		 308 aa  89  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03727  putative beta transglucosylase, GH17 family (Eurofung)  24.9 
 
 		 366 aa  87  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.774595 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  24.76 
 
 		 555 aa  87  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  29.5 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  25 
 
 		 303 aa  75.9  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  26.87 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32120  family 17 glucosidase SCW11 precursor (Soluble cell wall protein 11)  25.33 
 
 		 452 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.506951  normal  0.0756506 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89695  Soluble Cell Wall protein  25.83 
 
 		 369 aa  66.6  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  23.94 
 
 		 338 aa  64.3  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  25.09 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  22.52 
 
 		 1290 aa  57.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01551  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BD29]  25.42 
 
 		 555 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.550208  normal  0.0387764 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07950  Beta-1,3-endoglucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUT0]  24.53 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000158341  normal  0.358394 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  19.86 
 
 		 649 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>