51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4380 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 321 aa  671    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  73.68 
 
 		 336 aa  489  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.43 
 
 		 1290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  27.15 
 
 		 869 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  27.84 
 
 		 863 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0556  hypothetical protein  27.97 
 
 		 620 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 903 aa  101  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  27.55 
 
 		 863 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 868 aa  100  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 917 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 		 863 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 		 862 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 885 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  30.6 
 
 		 844 aa  96.3  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 831 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.17 
 
 		 842 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 		 863 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 859 aa  92  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  27.45 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  24.66 
 
 		 895 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  26.21 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 889 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  26.74 
 
 		 558 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  28.46 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 		 889 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  27.01 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  28.5 
 
 		 532 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 		 899 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  25.69 
 
 		 558 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  22.4 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  25.51 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  26.87 
 
 		 541 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  26.42 
 
 		 638 aa  73.2  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  25.96 
 
 		 521 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 		 895 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  25.26 
 
 		 525 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  27 
 
 		 536 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  25.26 
 
 		 521 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  23.89 
 
 		 541 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  23.13 
 
 		 919 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  25.65 
 
 		 540 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 		 944 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  25.76 
 
 		 533 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  24.91 
 
 		 522 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  23.99 
 
 		 905 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  24.14 
 
 		 538 aa  65.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  33.09 
 
 		 417 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 889 aa  56.6  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  24.25 
 
 		 535 aa  55.8  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  24.24 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>