More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1526 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  45.7 
 
 		 903 aa  746    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  44.88 
 
 		 917 aa  768    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  100 
 
 		 863 aa  1778    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.31 
 
 		 842 aa  838    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  95.48 
 
 		 863 aa  1676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  52.2 
 
 		 831 aa  859    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  82.24 
 
 		 863 aa  1432    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  41.22 
 
 		 868 aa  657    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  86.47 
 
 		 885 aa  1521    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  98.14 
 
 		 862 aa  1749    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 		 859 aa  647    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  99.65 
 
 		 863 aa  1774    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  76.53 
 
 		 869 aa  1383    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  40.07 
 
 		 895 aa  607  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 		 889 aa  587  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  38.99 
 
 		 889 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  39.04 
 
 		 899 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 895 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  36.64 
 
 		 944 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 919 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 844 aa  552  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 889 aa  537  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  38.35 
 
 		 905 aa  525  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 772 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  39.87 
 
 		 541 aa  234  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  38.81 
 
 		 650 aa  220  7e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  36.94 
 
 		 529 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  40.34 
 
 		 525 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  40.34 
 
 		 521 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 		 610 aa  213  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  40.55 
 
 		 522 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  36.18 
 
 		 531 aa  211  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  37.38 
 
 		 521 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  34.41 
 
 		 536 aa  204  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  34.29 
 
 		 558 aa  203  9e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  34.24 
 
 		 538 aa  203  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  38.56 
 
 		 535 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  36.56 
 
 		 533 aa  202  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  34.42 
 
 		 638 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  35.76 
 
 		 558 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  38.55 
 
 		 540 aa  195  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  33.05 
 
 		 494 aa  191  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  36.43 
 
 		 532 aa  190  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  32.79 
 
 		 541 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  30.69 
 
 		 295 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  27.9 
 
 		 295 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  30.33 
 
 		 652 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.34 
 
 		 652 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 		 658 aa  128  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.7 
 
 		 768 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.61 
 
 		 672 aa  126  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  28.05 
 
 		 666 aa  125  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.27 
 
 		 672 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  28 
 
 		 659 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  26.57 
 
 		 740 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.02 
 
 		 652 aa  122  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  28.11 
 
 		 749 aa  122  3.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  29.27 
 
 		 658 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  30.24 
 
 		 672 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  30.82 
 
 		 336 aa  120  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  27.16 
 
 		 1135 aa  119  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 		 514 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  28.08 
 
 		 661 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  25.45 
 
 		 683 aa  117  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  26.76 
 
 		 712 aa  116  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  29 
 
 		 655 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  29 
 
 		 657 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  29 
 
 		 655 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  29 
 
 		 655 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  29 
 
 		 655 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 		 659 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  24.8 
 
 		 716 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.34 
 
 		 811 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  29 
 
 		 664 aa  110  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 421 aa  109  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  27.5 
 
 		 737 aa  110  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  28.4 
 
 		 664 aa  109  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  26.51 
 
 		 501 aa  108  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  26.81 
 
 		 778 aa  108  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.42 
 
 		 930 aa  107  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  27.49 
 
 		 321 aa  107  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.74 
 
 		 544 aa  106  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  29.53 
 
 		 758 aa  105  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27 
 
 		 804 aa  105  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  23.71 
 
 		 702 aa  105  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  28 
 
 		 899 aa  103  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.01 
 
 		 810 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.17 
 
 		 773 aa  101  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  26.39 
 
 		 699 aa  101  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 		 773 aa  100  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.45 
 
 		 831 aa  100  8e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 508 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.1 
 
 		 743 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.38 
 
 		 718 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  27.71 
 
 		 899 aa  100  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.33 
 
 		 696 aa  99.8  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  25.59 
 
 		 872 aa  100  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.62 
 
 		 822 aa  100  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>