More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1089 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  81.69 
 
 		 863 aa  1415    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  45.93 
 
 		 903 aa  738    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  86.53 
 
 		 863 aa  1518    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.8 
 
 		 842 aa  845    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  51.45 
 
 		 831 aa  847    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 885 aa  1819    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  86.86 
 
 		 862 aa  1526    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  86.75 
 
 		 863 aa  1519    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  39.98 
 
 		 859 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  86.89 
 
 		 863 aa  1522    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  41.23 
 
 		 868 aa  660    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  74.88 
 
 		 869 aa  1342    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  44.07 
 
 		 917 aa  749    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  39.91 
 
 		 895 aa  621  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 		 889 aa  601  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  39.06 
 
 		 899 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 895 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  38.62 
 
 		 889 aa  591  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  36.74 
 
 		 919 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  36.55 
 
 		 944 aa  579  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  39.07 
 
 		 905 aa  554  1e-156  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 		 889 aa  549  1e-155  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  36.4 
 
 		 844 aa  547  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 		 772 aa  309  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  41.32 
 
 		 541 aa  241  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  38.6 
 
 		 529 aa  221  6e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  40.23 
 
 		 610 aa  220  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  35.6 
 
 		 531 aa  218  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  40.73 
 
 		 525 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  40.73 
 
 		 521 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  39.5 
 
 		 650 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  40.73 
 
 		 540 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  40.73 
 
 		 522 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  37.26 
 
 		 533 aa  213  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  37.19 
 
 		 521 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  33.51 
 
 		 558 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  38.24 
 
 		 535 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  34.77 
 
 		 536 aa  201  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  34.42 
 
 		 638 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  34.38 
 
 		 558 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  33.23 
 
 		 538 aa  196  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  32.43 
 
 		 541 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  35.45 
 
 		 532 aa  191  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  32.49 
 
 		 494 aa  188  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  31.06 
 
 		 295 aa  145  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  29.3 
 
 		 295 aa  138  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  30.69 
 
 		 652 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.48 
 
 		 652 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.87 
 
 		 768 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  25.34 
 
 		 716 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 658 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  26.65 
 
 		 666 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.75 
 
 		 652 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 514 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  28.69 
 
 		 712 aa  119  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  26.73 
 
 		 749 aa  119  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  28.15 
 
 		 740 aa  119  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.32 
 
 		 672 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.25 
 
 		 672 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  24.18 
 
 		 683 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.25 
 
 		 544 aa  112  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  26 
 
 		 672 aa  111  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  29.65 
 
 		 758 aa  110  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 523 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  27.76 
 
 		 659 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  26.06 
 
 		 501 aa  108  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.46 
 
 		 930 aa  108  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 659 aa  108  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  28.52 
 
 		 336 aa  107  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  26.07 
 
 		 661 aa  107  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.61 
 
 		 657 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  27.08 
 
 		 778 aa  106  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  26.46 
 
 		 501 aa  106  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  26.65 
 
 		 658 aa  106  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  26.23 
 
 		 501 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  27.61 
 
 		 655 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.73 
 
 		 980 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.61 
 
 		 657 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 		 533 aa  105  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  27.61 
 
 		 657 aa  104  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.01 
 
 		 811 aa  104  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.9 
 
 		 810 aa  104  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  27.61 
 
 		 655 aa  104  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  27.61 
 
 		 655 aa  104  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  27.61 
 
 		 655 aa  104  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  26.9 
 
 		 321 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.5 
 
 		 718 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.86 
 
 		 1135 aa  103  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  25 
 
 		 737 aa  103  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 		 501 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  24.76 
 
 		 546 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  31.16 
 
 		 422 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  26.89 
 
 		 664 aa  102  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 		 508 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  24.15 
 
 		 741 aa  101  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 421 aa  100  8e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.16 
 
 		 804 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 494 aa  99.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  27.45 
 
 		 649 aa  99.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.05 
 
 		 773 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>