More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_39140 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  82.24 
 
 
863 aa  1442    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  100 
 
 
863 aa  1765    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.74 
 
 
842 aa  834    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  51.82 
 
 
831 aa  843    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  44.67 
 
 
917 aa  746    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  82.48 
 
 
863 aa  1445    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  81.74 
 
 
885 aa  1432    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  41.39 
 
 
868 aa  672    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  83.1 
 
 
863 aa  1454    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  40.7 
 
 
859 aa  650    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  47.16 
 
 
903 aa  773    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  77.33 
 
 
869 aa  1377    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  82.61 
 
 
862 aa  1447    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  40.68 
 
 
895 aa  616  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  40.33 
 
 
899 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 
889 aa  594  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
895 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  38.89 
 
 
889 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
919 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  37.44 
 
 
944 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  37.9 
 
 
844 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  35.99 
 
 
889 aa  548  1e-154  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  38.34 
 
 
905 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  39.2 
 
 
772 aa  301  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
610 aa  235  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2837  glycoside hydrolase family protein  38.22 
 
 
529 aa  220  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.413837  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  39.75 
 
 
541 aa  218  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  36.95 
 
 
638 aa  211  4e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  40.36 
 
 
540 aa  210  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  35.14 
 
 
531 aa  207  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 
521 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  38.76 
 
 
525 aa  207  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  38.76 
 
 
521 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  39.04 
 
 
535 aa  205  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  38.06 
 
 
650 aa  204  8e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  39.26 
 
 
522 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  36.09 
 
 
536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  36.15 
 
 
558 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  36.22 
 
 
533 aa  202  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  35.36 
 
 
558 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  35.84 
 
 
538 aa  191  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  33.87 
 
 
541 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  33.15 
 
 
532 aa  183  9.000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  33.99 
 
 
494 aa  182  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  34.08 
 
 
295 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  30.71 
 
 
295 aa  145  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  27.54 
 
 
712 aa  126  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  31.27 
 
 
336 aa  124  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
658 aa  122  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  24.71 
 
 
716 aa  121  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
514 aa  121  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  30 
 
 
758 aa  120  9e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  27.07 
 
 
740 aa  120  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  27.92 
 
 
666 aa  119  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.25 
 
 
672 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  25 
 
 
683 aa  115  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  28.28 
 
 
321 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  26.85 
 
 
672 aa  115  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  27.91 
 
 
749 aa  114  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.64 
 
 
768 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.19 
 
 
804 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.62 
 
 
672 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  32.37 
 
 
788 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  31.7 
 
 
778 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.98 
 
 
930 aa  112  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  27.7 
 
 
652 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.46 
 
 
810 aa  110  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.52 
 
 
652 aa  110  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  32.97 
 
 
788 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  25.44 
 
 
523 aa  109  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  32.97 
 
 
788 aa  109  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  28.06 
 
 
659 aa  108  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.88 
 
 
544 aa  108  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.85 
 
 
822 aa  107  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.12 
 
 
811 aa  106  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.53 
 
 
831 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  27.57 
 
 
737 aa  105  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 
659 aa  104  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  26.38 
 
 
425 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.03 
 
 
834 aa  103  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  26.38 
 
 
425 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  33.2 
 
 
422 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.03 
 
 
980 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.55 
 
 
702 aa  103  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  27.56 
 
 
424 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  28.1 
 
 
773 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.31 
 
 
1135 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  26.19 
 
 
855 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.1 
 
 
773 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.78 
 
 
652 aa  102  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
546 aa  102  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  26.53 
 
 
664 aa  101  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  29.45 
 
 
658 aa  101  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
533 aa  101  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  29.35 
 
 
418 aa  101  7e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.09 
 
 
872 aa  101  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
501 aa  100  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  25.67 
 
 
501 aa  100  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 
1231 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  30.26 
 
 
726 aa  100  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>