More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2308 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2308  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
610 aa  1252    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0847563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
772 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  33.48 
 
 
863 aa  235  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 
917 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  31.08 
 
 
903 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  40.23 
 
 
885 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
889 aa  219  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 
889 aa  217  5.9999999999999996e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  31.75 
 
 
895 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  39.19 
 
 
863 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  42.04 
 
 
869 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  38.83 
 
 
863 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  39.84 
 
 
863 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
862 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
831 aa  212  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
919 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  37.22 
 
 
868 aa  211  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 
895 aa  211  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
899 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
944 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
905 aa  205  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.37 
 
 
842 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  39.59 
 
 
859 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
844 aa  183  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
889 aa  183  9.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  30.62 
 
 
716 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.15 
 
 
652 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  30.15 
 
 
652 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  29.34 
 
 
712 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 
688 aa  114  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  31.51 
 
 
749 aa  113  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
501 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  30.52 
 
 
740 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
591 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
620 aa  112  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
505 aa  111  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.39 
 
 
652 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  25.23 
 
 
737 aa  108  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.8 
 
 
980 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.88 
 
 
586 aa  105  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.5 
 
 
718 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
658 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  27.18 
 
 
758 aa  104  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  30.12 
 
 
490 aa  104  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
533 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1704  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
514 aa  102  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
659 aa  102  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.92 
 
 
768 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  30.2 
 
 
658 aa  102  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 
501 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.27 
 
 
544 aa  99.8  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  28.03 
 
 
655 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
501 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  28.46 
 
 
672 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
546 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.1 
 
 
657 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.03 
 
 
657 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  24.86 
 
 
672 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  28.03 
 
 
655 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  26.33 
 
 
707 aa  99  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  28.51 
 
 
659 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  28.74 
 
 
501 aa  99.4  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  28.03 
 
 
655 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  28.03 
 
 
655 aa  99  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  28.46 
 
 
672 aa  99  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  27.99 
 
 
664 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 
508 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  29.14 
 
 
778 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  28.03 
 
 
657 aa  99  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  30 
 
 
869 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  29.58 
 
 
869 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  28.57 
 
 
664 aa  98.2  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.61 
 
 
503 aa  97.8  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
1140 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
501 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  25 
 
 
666 aa  96.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  26.72 
 
 
683 aa  96.7  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
1140 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  25 
 
 
661 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  29.29 
 
 
1135 aa  96.3  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
1231 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 
1140 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 
547 aa  94.7  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0208  cellulose synthase (UDP-forming)  26.44 
 
 
564 aa  94.7  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0946427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  29.17 
 
 
869 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.61 
 
 
810 aa  94.4  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0197  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
426 aa  94  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
494 aa  93.2  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
421 aa  92.4  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
650 aa  91.7  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  27.53 
 
 
741 aa  90.5  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
492 aa  90.9  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.35 
 
 
930 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
773 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  28.01 
 
 
726 aa  90.1  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.16 
 
 
773 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
475 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
475 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
475 aa  89  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
420 aa  89.4  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>