More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6620 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
508 aa  1040    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  48.46 
 
 
490 aa  495  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  48.79 
 
 
494 aa  461  9.999999999999999e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  42.74 
 
 
501 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  41.99 
 
 
501 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 
501 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  41.18 
 
 
501 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  40.67 
 
 
546 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  42.89 
 
 
505 aa  332  8e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  39.32 
 
 
688 aa  326  5e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  44.04 
 
 
488 aa  323  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  42.96 
 
 
492 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  37.2 
 
 
533 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  38.93 
 
 
523 aa  300  3e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0285  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
443 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18489  predicted protein  36.83 
 
 
514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0623702  normal  0.762192 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1219  glycosyl transferase family 2  35.97 
 
 
439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0925  glycosyl transferase family 2  34.2 
 
 
586 aa  213  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_25890  predicted protein  34.75 
 
 
825 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.422329  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 
476 aa  140  6e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  35.46 
 
 
420 aa  138  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
520 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
520 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
520 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  31.91 
 
 
633 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 
399 aa  129  9.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.21 
 
 
505 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  31.43 
 
 
520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  33.1 
 
 
509 aa  128  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  31.21 
 
 
662 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
446 aa  127  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
393 aa  123  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  32.37 
 
 
661 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  29.31 
 
 
666 aa  121  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
475 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  27.33 
 
 
740 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  29.68 
 
 
749 aa  117  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  27.23 
 
 
895 aa  116  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.33 
 
 
672 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.39 
 
 
718 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.92 
 
 
672 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
899 aa  113  9e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  27.25 
 
 
672 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
1129 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.45 
 
 
664 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  36.45 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
483 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
502 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  32.07 
 
 
469 aa  110  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
868 aa  110  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  28.27 
 
 
501 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  30.53 
 
 
458 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
471 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.28 
 
 
768 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  31.43 
 
 
439 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
905 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  26.51 
 
 
895 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
476 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
944 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 
889 aa  108  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
903 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
919 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
889 aa  106  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.67 
 
 
532 aa  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  30.61 
 
 
737 aa  106  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  30.74 
 
 
664 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0335  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
459 aa  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.87 
 
 
804 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  26.93 
 
 
889 aa  105  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  30.14 
 
 
822 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 
591 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  26.59 
 
 
741 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  28.85 
 
 
859 aa  104  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  27.25 
 
 
1124 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 
1120 aa  103  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.73 
 
 
831 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  31.27 
 
 
475 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.34 
 
 
810 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  30 
 
 
443 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.29 
 
 
573 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  29.97 
 
 
626 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
433 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  25.06 
 
 
885 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  28.73 
 
 
834 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 
620 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
642 aa  101  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.29 
 
 
630 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  29.08 
 
 
778 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
772 aa  100  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  26.98 
 
 
442 aa  100  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  27.1 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  28.02 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  29.59 
 
 
683 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  26.67 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  28.02 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>