More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3257 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  100 
 
 		 624 aa  1266    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  51.18 
 
 		 514 aa  534  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4186  glycosyl transferase family 2  41.34 
 
 		 537 aa  347  4e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3154  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 		 620 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  30.79 
 
 		 749 aa  174  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  37.04 
 
 		 672 aa  172  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  37.04 
 
 		 672 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.06 
 
 		 672 aa  171  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  35.41 
 
 		 683 aa  171  5e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  32.26 
 
 		 737 aa  169  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  31.88 
 
 		 661 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  36.36 
 
 		 666 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1834  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 591 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172396  normal  0.276871 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.08 
 
 		 718 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.54 
 
 		 768 aa  164  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0230  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.56 
 
 		 586 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.634513  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  34.31 
 
 		 664 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.97 
 
 		 846 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.33 
 
 		 845 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  36.33 
 
 		 845 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 		 845 aa  158  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.95 
 
 		 848 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.95 
 
 		 848 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.95 
 
 		 848 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  37.15 
 
 		 664 aa  157  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.95 
 
 		 846 aa  157  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  34.85 
 
 		 846 aa  157  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  35.54 
 
 		 848 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  35.25 
 
 		 845 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  33 
 
 		 716 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  35.97 
 
 		 845 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  35.97 
 
 		 845 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 773 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.68 
 
 		 773 aa  151  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  32.57 
 
 		 855 aa  150  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.61 
 
 		 845 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  29.35 
 
 		 740 aa  148  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 		 1140 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  34.32 
 
 		 1140 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 		 658 aa  147  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  33.44 
 
 		 659 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 857 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 		 1140 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  29.43 
 
 		 741 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  25.72 
 
 		 872 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  25.72 
 
 		 872 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  25.72 
 
 		 872 aa  142  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.33 
 
 		 851 aa  141  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  25.72 
 
 		 872 aa  141  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  25.72 
 
 		 872 aa  142  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  25.72 
 
 		 872 aa  142  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  25.72 
 
 		 872 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  25.89 
 
 		 867 aa  140  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  26.27 
 
 		 874 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  26.27 
 
 		 874 aa  140  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  26.27 
 
 		 874 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  26.27 
 
 		 874 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  26.27 
 
 		 874 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  26.35 
 
 		 899 aa  139  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.39 
 
 		 730 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  31.69 
 
 		 1135 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  25.72 
 
 		 872 aa  138  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  24.83 
 
 		 872 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  30.16 
 
 		 869 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  29.97 
 
 		 712 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  34.29 
 
 		 730 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  25.88 
 
 		 899 aa  136  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  30.56 
 
 		 869 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  31.44 
 
 		 778 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  32.74 
 
 		 726 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0232  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.82 
 
 		 544 aa  135  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  33.72 
 
 		 743 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  32.57 
 
 		 734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  25.97 
 
 		 739 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  32.57 
 
 		 734 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  30.23 
 
 		 869 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 1129 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29 
 
 		 702 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0273  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.04 
 
 		 652 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.79882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  25.13 
 
 		 872 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  28.02 
 
 		 788 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  34.6 
 
 		 1455 aa  128  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  31.79 
 
 		 811 aa  127  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3042  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.14 
 
 		 980 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0324719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  29.71 
 
 		 1231 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1164  cellulose synthase (UDP-forming)  29.27 
 
 		 652 aa  125  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  30 
 
 		 655 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  30 
 
 		 655 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  30 
 
 		 655 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 657 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  30 
 
 		 657 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  30 
 
 		 655 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  28.79 
 
 		 699 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1518  glycosyl transferase family 2  27.99 
 
 		 547 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.5 
 
 		 696 aa  124  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  26.49 
 
 		 788 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  26.49 
 
 		 788 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  30.57 
 
 		 652 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.68 
 
 		 657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  28.97 
 
 		 501 aa  122  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.832352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>