28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0556 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0556  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1269    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  45.22 
 
 		 1290 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4380  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 		 321 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  27.48 
 
 		 336 aa  99.8  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.47 
 
 		 842 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  23.46 
 
 		 869 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  24.79 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  22.42 
 
 		 844 aa  59.3  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  25.07 
 
 		 868 aa  56.6  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  24.63 
 
 		 304 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  22.44 
 
 		 541 aa  55.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  22.57 
 
 		 650 aa  53.9  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 		 831 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 		 885 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  22.11 
 
 		 532 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  22.25 
 
 		 533 aa  50.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  21.4 
 
 		 859 aa  48.9  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  22.32 
 
 		 917 aa  48.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  22.16 
 
 		 558 aa  47.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  22.04 
 
 		 536 aa  47.8  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  22.66 
 
 		 494 aa  47.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  22.65 
 
 		 531 aa  47.4  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  22.29 
 
 		 863 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  21.47 
 
 		 863 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  20 
 
 		 903 aa  45.1  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  19.8 
 
 		 540 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  24.45 
 
 		 295 aa  43.9  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  22.46 
 
 		 638 aa  43.9  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>