51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN00660 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN00660  glucan 1,3 beta-glucosidase protein putative  100 
 
 
249 aa  508  1e-143  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28554  Cell wall endo-beta-1,3-glucanase  31.43 
 
 
555 aa  137  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.496398  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04700  Endo-beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B430]  33.6 
 
 
649 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.361112  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
889 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  23.11 
 
 
868 aa  72.4  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
889 aa  72.4  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
944 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 
895 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  23.77 
 
 
844 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  28 
 
 
863 aa  69.3  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49360  glucosyl transferase  30.13 
 
 
869 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.169531  normal  0.125269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
919 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1290  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 
521 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1332  beta (1-6) glucans synthase  27.18 
 
 
522 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.438077  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
885 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 
899 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3979  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  26.7 
 
 
521 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.724466  normal  0.625635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  26.63 
 
 
905 aa  64.7  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
863 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  27.2 
 
 
895 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1740  beta (1-6) glucans synthase, putative  26.7 
 
 
525 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35060  Glycoside hydrolase  26.72 
 
 
533 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.923975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  28 
 
 
863 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3208  putative glucan 1,3-beta-glucosidase  23.91 
 
 
540 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.537701  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
862 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1668  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  24.9 
 
 
650 aa  63.2  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.137314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
863 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  24.67 
 
 
903 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1605  glycoside hydrolase family protein  26.69 
 
 
531 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3721  putative glycosyl hydrolase  25.43 
 
 
295 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.439077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4379  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 
295 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
889 aa  58.2  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0068  exo-beta-1 3-glucanase-like  38.95 
 
 
638 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00110829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4421  putative beta (1-6) glucans synthase  26.16 
 
 
541 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0112946  normal  0.554528 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1372  glycosyl transferase family protein  25.34 
 
 
859 aa  57.8  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0188568  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2930  putative beta (1-6) glucans synthase, NdvC-like protein  23.18 
 
 
536 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0666963  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1373  putative beta (1-6) glucan synthase  23.95 
 
 
535 aa  55.8  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000927844  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
917 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2614  putative beta (1-6) glucans synthase  25.32 
 
 
558 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.272631  hitchhiker  0.00127237 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74722  Glycoside hydrolase, family 17  23.55 
 
 
308 aa  53.1  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154228  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10150  Putative beta-transglucosylase. Family GH17. A fumigatus Bgt1-like (Eurofung)  24.8 
 
 
304 aa  52  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251061  normal  0.119691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1524  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.31 
 
 
842 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1332  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 
831 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0376589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4171  putative beta (1-6) glucans synthase, ndvC-like protein  23.75 
 
 
538 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2858  putative beta (1-6) glucans synthase  24.89 
 
 
558 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.178086  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57025  cell wall glucanase Probable family 17 glucosidase SCW4 precursor (Soluble cell wall protein 4)  27.01 
 
 
303 aa  49.3  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.277446  normal  0.953702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0507  exo-beta-1 3-glucanase-like protein  24.4 
 
 
338 aa  46.6  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1787  putative beta (1-6) glucans synthase  22.75 
 
 
532 aa  45.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2602  putative beta (1-6) glucans synthase  23.75 
 
 
541 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.288043  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3720  putative glycosyl hydrolase  28.15 
 
 
336 aa  43.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1781  putative beta (1-6) glucans synthase  23.25 
 
 
494 aa  42  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>