More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4949 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
446 aa  909    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  57.24 
 
 
476 aa  520  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  57.45 
 
 
505 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  57.45 
 
 
520 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  57.45 
 
 
662 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  57.21 
 
 
509 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  57.21 
 
 
633 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  56.47 
 
 
509 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  57.46 
 
 
520 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  57.46 
 
 
520 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  57.46 
 
 
520 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  49.74 
 
 
399 aa  389  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  33.24 
 
 
483 aa  164  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
471 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
546 aa  136  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
420 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 
393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 
688 aa  127  5e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
549 aa  127  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  25.87 
 
 
490 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
475 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  29.14 
 
 
501 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
475 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.39 
 
 
1115 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  31.75 
 
 
872 aa  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 
533 aa  123  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  31.75 
 
 
927 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  31.75 
 
 
1115 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
1115 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  31.75 
 
 
1119 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  29.14 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  27.39 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
494 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
501 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  31.02 
 
 
1115 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
509 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 
1154 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 
501 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
1002 aa  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
488 aa  116  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
476 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.29 
 
 
752 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  30.8 
 
 
439 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  35.66 
 
 
637 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
468 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 
789 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  33.85 
 
 
422 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 
789 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  31.71 
 
 
789 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.63 
 
 
1099 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18489  predicted protein  28.12 
 
 
514 aa  113  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0623702  normal  0.762192 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
410 aa  113  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  30.66 
 
 
458 aa  112  9e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  31.23 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  30.77 
 
 
469 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 
523 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  30.88 
 
 
433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 
905 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  30.28 
 
 
433 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  32.93 
 
 
1101 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  30.53 
 
 
433 aa  110  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
492 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  30.53 
 
 
433 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  30.53 
 
 
433 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  29.55 
 
 
441 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
441 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  29.55 
 
 
441 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  29.55 
 
 
441 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  29.55 
 
 
412 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  26.87 
 
 
433 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  29.55 
 
 
441 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  29.55 
 
 
412 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  29.24 
 
 
395 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
438 aa  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  31.75 
 
 
443 aa  107  5e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
437 aa  106  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  33.05 
 
 
461 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 
1124 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  29.37 
 
 
444 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  29.37 
 
 
444 aa  104  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  29.37 
 
 
444 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
433 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  30.22 
 
 
1120 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  31.27 
 
 
497 aa  103  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
388 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
944 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
425 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  28.31 
 
 
1118 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  25.52 
 
 
412 aa  101  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
473 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
895 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
899 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  26.09 
 
 
442 aa  100  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  23.79 
 
 
480 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  31.12 
 
 
423 aa  100  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>