More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5475 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  75.77 
 
 		 520 aa  771    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  75.96 
 
 		 662 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  76.25 
 
 		 633 aa  782    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  82.67 
 
 		 520 aa  835    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  83.08 
 
 		 520 aa  834    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  97.84 
 
 		 509 aa  1006    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 509 aa  1027    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  82.67 
 
 		 520 aa  835    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  77.23 
 
 		 505 aa  763    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  57.21 
 
 		 476 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  56.47 
 
 		 446 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  46.33 
 
 		 399 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  35.22 
 
 		 483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  34.2 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 		 501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 		 501 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 		 501 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 546 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  33.46 
 
 		 505 aa  137  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  32.83 
 
 		 494 aa  137  6.0000000000000005e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  31.64 
 
 		 420 aa  137  7.000000000000001e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 		 395 aa  131  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 		 549 aa  131  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.89 
 
 		 752 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  35.11 
 
 		 1099 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  30.91 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  32.39 
 
 		 1120 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  32.74 
 
 		 508 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 523 aa  127  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  30.79 
 
 		 492 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  35.77 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  37.12 
 
 		 637 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 789 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 789 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  28.4 
 
 		 789 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  29.85 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 393 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  30.6 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 475 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 475 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  26.84 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 1002 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.82 
 
 		 872 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  31.06 
 
 		 418 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 		 1101 aa  113  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.12 
 
 		 1115 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.12 
 
 		 1115 aa  113  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.12 
 
 		 927 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.91 
 
 		 1119 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  31.1 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 919 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  32.74 
 
 		 1118 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 473 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  29.79 
 
 		 497 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  28.3 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  28.3 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  28.3 
 
 		 412 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  28.3 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  28.3 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.94 
 
 		 1115 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18489  predicted protein  28.15 
 
 		 514 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0623702  normal  0.762192 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  27.27 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 944 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  29.45 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  29.55 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  28.33 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  28.31 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  29.55 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  29.55 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  28.31 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.6 
 
 		 1115 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.8 
 
 		 403 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  26.99 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  29.1 
 
 		 435 aa  107  7e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  29.68 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  33.86 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  30.13 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 899 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 895 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  26.48 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  26.48 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  30.88 
 
 		 1124 aa  104  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  28.87 
 
 		 423 aa  104  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  26.72 
 
 		 696 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  26.48 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  26.48 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  26.48 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>