More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0183 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
395 aa  794    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  57.25 
 
 
393 aa  431  1e-119  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
420 aa  192  9e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  34.98 
 
 
399 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  33.44 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
549 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.44 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
473 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  33.44 
 
 
662 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  36.6 
 
 
469 aa  133  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 
476 aa  133  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  28.06 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
509 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
501 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  34.47 
 
 
468 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
520 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
520 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 
520 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  27.81 
 
 
433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  27.81 
 
 
433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  27.58 
 
 
546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  28.06 
 
 
433 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  27.81 
 
 
433 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  31.16 
 
 
633 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 
533 aa  129  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  27.81 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
501 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
433 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  28.06 
 
 
433 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 
501 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 
509 aa  127  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  32.82 
 
 
410 aa  127  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  30.03 
 
 
494 aa  126  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  28.87 
 
 
442 aa  126  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  27.89 
 
 
412 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 
501 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  30.62 
 
 
418 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  30.89 
 
 
418 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  27.6 
 
 
412 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 
443 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  27.6 
 
 
441 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
441 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  28.87 
 
 
442 aa  124  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  27.6 
 
 
441 aa  124  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  27.6 
 
 
441 aa  124  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  27.6 
 
 
441 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  33.62 
 
 
458 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  33.45 
 
 
509 aa  123  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
508 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
654 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  26.4 
 
 
411 aa  120  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
502 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
492 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 
1101 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  29.84 
 
 
417 aa  119  9e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 
471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
1002 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  27.46 
 
 
424 aa  116  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  29.33 
 
 
443 aa  117  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  32.92 
 
 
412 aa  116  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  28.21 
 
 
635 aa  116  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  30.84 
 
 
422 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  29.45 
 
 
490 aa  116  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  25.69 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.11 
 
 
403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  25.42 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  27.56 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
505 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  27.56 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  25.9 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
1124 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.42 
 
 
630 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 
443 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.42 
 
 
573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  27.65 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.37 
 
 
1120 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  26.41 
 
 
442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  29.67 
 
 
439 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  25.41 
 
 
423 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  25.41 
 
 
423 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  25.41 
 
 
423 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 
626 aa  113  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  29.92 
 
 
423 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  25.54 
 
 
451 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  27.79 
 
 
604 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 
789 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 
789 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  27.79 
 
 
636 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 
789 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  26.4 
 
 
399 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  26.4 
 
 
399 aa  109  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17851  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
437 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.83 
 
 
461 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  27.7 
 
 
444 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  27.7 
 
 
444 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  27.7 
 
 
444 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>