More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2388 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  100 
 
 		 635 aa  1264    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  45 
 
 		 698 aa  482  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  44.86 
 
 		 628 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  45.34 
 
 		 636 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  45.85 
 
 		 604 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  42.76 
 
 		 654 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  46.8 
 
 		 509 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 		 624 aa  327  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  39.75 
 
 		 652 aa  325  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  36.83 
 
 		 642 aa  320  6e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  36.03 
 
 		 626 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 		 664 aa  280  7e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  38.41 
 
 		 626 aa  280  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.91 
 
 		 532 aa  279  1e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  43.11 
 
 		 673 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  41.04 
 
 		 612 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 		 686 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  35.48 
 
 		 475 aa  261  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  40.48 
 
 		 464 aa  259  7e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  40.21 
 
 		 464 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  40.48 
 
 		 683 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  40.21 
 
 		 417 aa  259  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.45 
 
 		 630 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.86 
 
 		 573 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 		 848 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 		 512 aa  254  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 		 476 aa  252  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  30.69 
 
 		 606 aa  247  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  42.46 
 
 		 678 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  37.45 
 
 		 615 aa  243  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  36.34 
 
 		 616 aa  240  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  39.33 
 
 		 650 aa  240  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  41.33 
 
 		 537 aa  239  8e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  36.17 
 
 		 664 aa  239  9e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  43.32 
 
 		 656 aa  236  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  40.53 
 
 		 614 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  40.51 
 
 		 492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  41.58 
 
 		 596 aa  233  6e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 		 678 aa  230  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 		 632 aa  229  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.91 
 
 		 656 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 420 aa  153  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  40.1 
 
 		 216 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 		 450 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  41.54 
 
 		 219 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  42.69 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 461 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 395 aa  119  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 393 aa  108  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 476 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 		 475 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 471 aa  105  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  29.01 
 
 		 475 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 533 aa  104  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  28.12 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  28.15 
 
 		 433 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 433 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  28.57 
 
 		 433 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  28.57 
 
 		 433 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 502 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 468 aa  98.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 		 433 aa  98.2  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 549 aa  98.2  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 433 aa  97.4  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  31.82 
 
 		 458 aa  96.7  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  27.54 
 
 		 469 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  27.34 
 
 		 433 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 399 aa  95.1  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 546 aa  95.5  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 505 aa  95.1  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 501 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 501 aa  94.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  29.31 
 
 		 520 aa  94.7  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 473 aa  94  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.05 
 
 		 505 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  29.05 
 
 		 662 aa  92.8  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  26.5 
 
 		 501 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 483 aa  92  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  30.4 
 
 		 633 aa  91.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 508 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.25 
 
 		 644 aa  90.5  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 		 421 aa  89  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 501 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 520 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  27.24 
 
 		 490 aa  88.6  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 520 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 520 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  24.54 
 
 		 494 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 509 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 509 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  31.43 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  28.08 
 
 		 712 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17851  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 889 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1831  glycosyltransferase  26.62 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  24.09 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  23.7 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2112  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 903 aa  80.1  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>