More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2129 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  73.02 
 
 
442 aa  666    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  100 
 
 
444 aa  901    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  69.93 
 
 
451 aa  642    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  100 
 
 
444 aa  901    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  100 
 
 
444 aa  901    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  73.24 
 
 
442 aa  675    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  66.21 
 
 
441 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  66.21 
 
 
441 aa  622  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  66.21 
 
 
441 aa  622  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  66.21 
 
 
441 aa  622  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  66.21 
 
 
441 aa  622  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  67.72 
 
 
412 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  67.72 
 
 
412 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  58.11 
 
 
418 aa  498  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  58.05 
 
 
417 aa  483  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  54.2 
 
 
418 aa  478  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  56.45 
 
 
421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  55.72 
 
 
421 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  56.2 
 
 
421 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  53.16 
 
 
423 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  53.16 
 
 
423 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  52.67 
 
 
423 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  50.61 
 
 
433 aa  431  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  52.67 
 
 
423 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  52.67 
 
 
423 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  51.33 
 
 
424 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  51.69 
 
 
425 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  51.69 
 
 
425 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  51.82 
 
 
423 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  51.94 
 
 
423 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  47.84 
 
 
410 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  40.44 
 
 
412 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  40.15 
 
 
399 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  40.15 
 
 
399 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  42.16 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  41.18 
 
 
422 aa  291  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 
425 aa  289  7e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  32.09 
 
 
442 aa  211  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
443 aa  199  6e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.59 
 
 
1099 aa  152  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  36.63 
 
 
428 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
752 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 
1120 aa  143  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  31.27 
 
 
1124 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 
637 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 
1101 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 
549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.02 
 
 
1115 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.02 
 
 
872 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 
1118 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.32 
 
 
927 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.32 
 
 
1119 aa  126  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.32 
 
 
1115 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 
466 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 
1115 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  33.87 
 
 
445 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.07 
 
 
1154 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  29.27 
 
 
461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.56 
 
 
1115 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
445 aa  121  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
789 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
789 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  29.74 
 
 
789 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
1002 aa  120  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  30.26 
 
 
403 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
464 aa  119  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  30.64 
 
 
411 aa  117  5e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
509 aa  114  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  30.48 
 
 
694 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 
433 aa  113  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
479 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
479 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 
479 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
395 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
477 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
446 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
464 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 
475 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
450 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  25.32 
 
 
437 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  26.83 
 
 
478 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  25.4 
 
 
452 aa  100  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
379 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  24.49 
 
 
480 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  26.93 
 
 
424 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
433 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  27.56 
 
 
425 aa  97.4  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
441 aa  97.1  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  25.69 
 
 
433 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
485 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
485 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  24.63 
 
 
648 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
485 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.57 
 
 
505 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  25.69 
 
 
433 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  25.69 
 
 
433 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 
470 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
387 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>