More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2439 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
464 aa  928    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  52.97 
 
 
479 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  53.3 
 
 
479 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  53.3 
 
 
479 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  49.44 
 
 
470 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  45.12 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  44.92 
 
 
469 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  45.32 
 
 
466 aa  372  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  43.04 
 
 
472 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  43.84 
 
 
1184 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1815  glycosyl transferase family 2  44.35 
 
 
467 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  43.89 
 
 
475 aa  353  5e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  42.89 
 
 
475 aa  348  9e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  38.72 
 
 
477 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2254  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
486 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2253  glycosyl transferase family 2  34.3 
 
 
498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  43.51 
 
 
484 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.86 
 
 
422 aa  273  6e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.56 
 
 
872 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.58 
 
 
927 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.51 
 
 
1115 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.58 
 
 
1115 aa  190  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.58 
 
 
1119 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.34 
 
 
1115 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.67 
 
 
1115 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 
1154 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.64 
 
 
752 aa  156  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 
789 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 
789 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
512 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  28.96 
 
 
789 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.4 
 
 
1099 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 
481 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  24.68 
 
 
1118 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  24.23 
 
 
1124 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 
1101 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7084  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
483 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  30.72 
 
 
399 aa  140  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  30.72 
 
 
399 aa  140  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 
1120 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
1002 aa  138  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0202  putative glycosyltransferase  29.85 
 
 
483 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  27.61 
 
 
412 aa  130  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  27.61 
 
 
441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  27.61 
 
 
441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  27.61 
 
 
412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 
441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  27.61 
 
 
441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  27.61 
 
 
441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  30.55 
 
 
412 aa  130  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  29.68 
 
 
442 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
637 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  29.26 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
428 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
509 aa  127  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.97 
 
 
403 aa  126  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
445 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  30.14 
 
 
421 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  29.01 
 
 
421 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  29.08 
 
 
421 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
410 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  28.36 
 
 
422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4179  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.2 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  28.57 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  27.89 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  28.57 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  28.57 
 
 
444 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 
442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  29.89 
 
 
452 aa  116  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  26.88 
 
 
424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  28.77 
 
 
451 aa  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.62 
 
 
411 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  30.53 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
445 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0448  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  27.73 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  27.73 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  26.91 
 
 
437 aa  111  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  27.33 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  27.33 
 
 
423 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  27.33 
 
 
423 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1474  glycosyltransferase  31.43 
 
 
447 aa  110  6e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  28.01 
 
 
423 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
466 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  26.46 
 
 
423 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  26.46 
 
 
423 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  26.46 
 
 
423 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  28.62 
 
 
417 aa  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  24.73 
 
 
425 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.15 
 
 
694 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.93 
 
 
461 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
483 aa  104  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  28.77 
 
 
442 aa  105  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  25.79 
 
 
418 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
429 aa  103  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
443 aa  102  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
425 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>