More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2212 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
648 aa  1344    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  40.62 
 
 
433 aa  314  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.42 
 
 
397 aa  197  7e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  29.6 
 
 
478 aa  191  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
485 aa  187  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
485 aa  187  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
485 aa  187  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  29.11 
 
 
480 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6186  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
426 aa  150  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7721  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
445 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3830  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
415 aa  144  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5038  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
426 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4027  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 
484 aa  139  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4918  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
426 aa  135  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7281  hyaluronan synthase  26.32 
 
 
426 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265868  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28550  glycosyl transferase  27.78 
 
 
449 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00136572  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.39 
 
 
1154 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.71 
 
 
927 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.71 
 
 
1115 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.71 
 
 
872 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
549 aa  115  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  25.76 
 
 
752 aa  114  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.12 
 
 
1115 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.43 
 
 
1119 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.47 
 
 
1115 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.86 
 
 
1115 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  25.82 
 
 
417 aa  112  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
509 aa  110  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.39 
 
 
1099 aa  110  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  31.33 
 
 
461 aa  110  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3194  Hyaluronan synthase  25.15 
 
 
531 aa  109  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019768 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.33 
 
 
1101 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1161  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
531 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231473  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
445 aa  107  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
1002 aa  103  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.29 
 
 
441 aa  100  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.29 
 
 
441 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.29 
 
 
441 aa  100  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.9 
 
 
412 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.29 
 
 
441 aa  100  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.29 
 
 
441 aa  100  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  27.14 
 
 
412 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.46 
 
 
1124 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  26.88 
 
 
399 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  26.88 
 
 
399 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 
464 aa  98.2  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.88 
 
 
451 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
483 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  25.52 
 
 
412 aa  96.3  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.18 
 
 
1118 aa  97.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  24.63 
 
 
444 aa  96.3  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  24.63 
 
 
444 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  24.63 
 
 
444 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  24.49 
 
 
418 aa  95.5  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.75 
 
 
1120 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2252  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
414 aa  93.2  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  25.69 
 
 
442 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  25.69 
 
 
442 aa  92.8  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
479 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.67 
 
 
403 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  23.52 
 
 
450 aa  92.8  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
445 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 
378 aa  92  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
789 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 
466 aa  91.7  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
789 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.49 
 
 
789 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
423 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  26.25 
 
 
452 aa  91.3  6e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
428 aa  90.9  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.14 
 
 
472 aa  90.5  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29105  chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase 3  25.17 
 
 
1202 aa  90.5  9e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.196175  hitchhiker  0.000301151 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  27.05 
 
 
421 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
399 aa  90.1  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
410 aa  89.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
423 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
1184 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06318  Chitin synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13281]  26.06 
 
 
1852 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15619  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  27.05 
 
 
421 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01610  chitin synthase-related  26.07 
 
 
1895 aa  89.4  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 
479 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  27.05 
 
 
421 aa  89.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
637 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 
476 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 
479 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  22.8 
 
 
470 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  24.71 
 
 
425 aa  88.2  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  32.42 
 
 
433 aa  87.8  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  23.68 
 
 
424 aa  88.2  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 
484 aa  87.8  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 
441 aa  87.8  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  23.85 
 
 
418 aa  87.4  7e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.98 
 
 
380 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  25 
 
 
437 aa  86.7  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  25.15 
 
 
477 aa  85.5  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0358  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
458 aa  85.5  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  23.86 
 
 
520 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  23.53 
 
 
411 aa  84  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>