More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6186 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6186  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 426 aa  871    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4918  glycosyl transferase family 2  71.13 
 
 		 426 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4027  glycosyl transferase family 2  72.15 
 
 		 484 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5038  glycosyl transferase family 2  68.54 
 
 		 426 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7721  glycosyl transferase family protein  67.25 
 
 		 445 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3830  glycosyl transferase family protein  63.97 
 
 		 415 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.74 
 
 		 397 aa  229  1e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 648 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  28.57 
 
 		 478 aa  141  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  31.62 
 
 		 480 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7281  hyaluronan synthase  28.72 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265868  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28550  glycosyl transferase  29.25 
 
 		 449 aa  122  9e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00136572  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 1101 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 445 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 485 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 		 485 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.95 
 
 		 752 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  32.4 
 
 		 1124 aa  110  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 		 423 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3194  Hyaluronan synthase  31 
 
 		 531 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019768 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.71 
 
 		 1115 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  30.71 
 
 		 927 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.71 
 
 		 1115 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.71 
 
 		 1119 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  32.49 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  30.29 
 
 		 872 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  30.95 
 
 		 1154 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 509 aa  104  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  31.23 
 
 		 694 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  30.29 
 
 		 1115 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 		 1002 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  25.95 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.88 
 
 		 1115 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1161  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 		 531 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  26.96 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 549 aa  97.4  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  29.11 
 
 		 1118 aa  97.4  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 		 483 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  27.46 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  31.67 
 
 		 1099 aa  94.7  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 466 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  28.97 
 
 		 497 aa  93.6  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 495 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.97 
 
 		 1120 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06318  Chitin synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13281]  26.57 
 
 		 1852 aa  90.5  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.03 
 
 		 403 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01555  Chitin synthase D (EC 2.4.1.16)(Chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase D)(Class-V chitin synthase D) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P78611]  32.26 
 
 		 1194 aa  86.7  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.058533  normal  0.103858 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2252  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 414 aa  86.7  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0358  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 458 aa  86.7  7e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  25 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 445 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02270  chitin synthase 4, putative  25.47 
 
 		 1423 aa  84.3  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.240777  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 494 aa  84.3  0.000000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  28.08 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 		 637 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29105  chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase 3  30.65 
 
 		 1202 aa  82.4  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.196175  hitchhiker  0.000301151 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0791  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  25.4 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05300  chitin synthase 6, putative  25.68 
 
 		 1271 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  26.47 
 
 		 716 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  24.58 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 		 450 aa  80.9  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  26.94 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  26.1 
 
 		 737 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  29.63 
 
 		 624 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  24.6 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  24.6 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  24.6 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  24.6 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06317  Chitin synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2L6A0]  26.88 
 
 		 1739 aa  76.6  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  25.2 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  28.67 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01610  chitin synthase-related  25.31 
 
 		 1895 aa  76.3  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  26.74 
 
 		 672 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  28.67 
 
 		 662 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  25.2 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.67 
 
 		 505 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  25.09 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  25.09 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0464  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 631 aa  76.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  27.31 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  27.31 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.16 
 
 		 514 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  27.49 
 
 		 672 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  27.31 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.46 
 
 		 834 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  27.31 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  27.31 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  27.31 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.46 
 
 		 831 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>