More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4027 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4027  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
484 aa  985    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3830  glycosyl transferase family protein  70.41 
 
 
415 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6186  glycosyl transferase family protein  72.15 
 
 
426 aa  596  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4918  glycosyl transferase family 2  67.14 
 
 
426 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7721  glycosyl transferase family protein  72.93 
 
 
445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5038  glycosyl transferase family 2  70.43 
 
 
426 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.25 
 
 
397 aa  226  9e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  35.08 
 
 
433 aa  147  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 
648 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  31.75 
 
 
1124 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  25.26 
 
 
480 aa  126  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28550  glycosyl transferase  30.11 
 
 
449 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00136572  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  27.47 
 
 
478 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.7 
 
 
1101 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7281  hyaluronan synthase  28.69 
 
 
426 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265868  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
1002 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
445 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  31.87 
 
 
1154 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  31.02 
 
 
461 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3194  Hyaluronan synthase  26.65 
 
 
531 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019768 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 
423 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
423 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
485 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
485 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
485 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  28.86 
 
 
1118 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 
752 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.98 
 
 
927 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.98 
 
 
1115 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.98 
 
 
1119 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.98 
 
 
1115 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.57 
 
 
872 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 
1120 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  26.6 
 
 
437 aa  95.9  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.98 
 
 
1115 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
466 aa  93.2  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1161  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
531 aa  93.2  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231473  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.96 
 
 
1099 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.16 
 
 
1115 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
483 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 
509 aa  90.1  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
549 aa  89.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  27.95 
 
 
694 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  29.72 
 
 
411 aa  87  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06318  Chitin synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13281]  25.73 
 
 
1852 aa  85.1  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15619  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2252  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 
414 aa  82.8  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
495 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  28.4 
 
 
497 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 
450 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 
637 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.51 
 
 
514 aa  81.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01555  Chitin synthase D (EC 2.4.1.16)(Chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase D)(Class-V chitin synthase D) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P78611]  30.05 
 
 
1194 aa  80.9  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.058533  normal  0.103858 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29105  chitin-UDP acetyl-glucosaminyl transferase 3  25.82 
 
 
1202 aa  80.9  0.00000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.196175  hitchhiker  0.000301151 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
445 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  26.03 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  26.03 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05300  chitin synthase 6, putative  26.28 
 
 
1271 aa  77.8  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  24.5 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  26.86 
 
 
393 aa  77  0.0000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
433 aa  77  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  29.29 
 
 
716 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.37 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  24.62 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  24.62 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
494 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
399 aa  76.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  24.48 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  25.28 
 
 
475 aa  74.7  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  27.35 
 
 
624 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  25.98 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0358  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
458 aa  73.9  0.000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  24.14 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  24.89 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  24.51 
 
 
424 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02270  chitin synthase 4, putative  29.38 
 
 
1423 aa  73.6  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.240777  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
450 aa  73.6  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  23.97 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  24.14 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  24.14 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  22.85 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0791  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  23.55 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  24.81 
 
 
737 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  23.88 
 
 
509 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06317  Chitin synthase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2L6A0]  27.43 
 
 
1739 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  24.48 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  27.12 
 
 
418 aa  71.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  28.57 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
512 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  25.41 
 
 
672 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  22.99 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  22.99 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  22.99 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>