More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_22610 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  100 
 
 
497 aa  1008    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  58.26 
 
 
494 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  55.76 
 
 
495 aa  522  1e-147  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 
789 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 
789 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 
789 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  36.4 
 
 
1120 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
428 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  34.72 
 
 
752 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  28.49 
 
 
433 aa  134  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  28.49 
 
 
433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  28.96 
 
 
433 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  28.96 
 
 
433 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  28.96 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.48 
 
 
1101 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  28.61 
 
 
433 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  29.27 
 
 
422 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  31.35 
 
 
403 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  35.85 
 
 
1124 aa  126  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  28.92 
 
 
411 aa  123  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.97 
 
 
872 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.57 
 
 
1115 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.62 
 
 
1115 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.16 
 
 
1099 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.97 
 
 
927 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
509 aa  117  6.9999999999999995e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.97 
 
 
1115 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.97 
 
 
1119 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.62 
 
 
1115 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  33.69 
 
 
549 aa  113  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  33.58 
 
 
1154 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
509 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
475 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
520 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
509 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 
520 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  31.73 
 
 
461 aa  109  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  30.61 
 
 
633 aa  109  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  29.89 
 
 
476 aa  108  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
520 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
1002 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
466 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  35.39 
 
 
1118 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
429 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  30.61 
 
 
520 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.61 
 
 
505 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  27.72 
 
 
478 aa  106  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  27.87 
 
 
694 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  31.3 
 
 
662 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  35.15 
 
 
439 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
632 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
446 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
483 aa  103  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  27.4 
 
 
458 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 
637 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
438 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
399 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  34.31 
 
 
443 aa  101  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  28.62 
 
 
469 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  28.05 
 
 
480 aa  100  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  29.1 
 
 
442 aa  99  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
420 aa  98.2  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
425 aa  97.8  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
443 aa  97.8  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  25.51 
 
 
412 aa  97.1  7e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18491  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
433 aa  97.1  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.468741  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
410 aa  96.7  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
508 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5038  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 
426 aa  96.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
505 aa  96.3  1e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  30.47 
 
 
423 aa  96.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 
483 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  29.46 
 
 
423 aa  95.9  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  26.85 
 
 
533 aa  95.1  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
420 aa  95.9  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 
523 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
433 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  25.45 
 
 
433 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 
546 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  29.46 
 
 
423 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  26.2 
 
 
442 aa  95.1  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 
444 aa  95.1  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  29.46 
 
 
423 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  29.46 
 
 
423 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  29.46 
 
 
423 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  29.46 
 
 
423 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
433 aa  94.7  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
450 aa  94  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6186  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 
426 aa  93.6  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.99 
 
 
466 aa  93.2  9e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 
476 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
365 aa  92.8  1e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
501 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
501 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18681  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>