More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2042 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  99.79 
 
 		 466 aa  951    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 466 aa  953    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1788  glycosyl transferase family protein  46.55 
 
 		 418 aa  431  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0333  glycosyl transferase family 2  48.28 
 
 		 420 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0177  glycosyl transferase family 2  44.12 
 
 		 425 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00145418  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  49.2 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  46.35 
 
 		 437 aa  323  4e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  35.79 
 
 		 417 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  42.72 
 
 		 424 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 438 aa  256  7e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1499  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0824671  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1842  cell wall membrane glycosyltransferase  35.25 
 
 		 407 aa  238  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.606296  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1210  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 		 444 aa  233  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.47071  normal  0.038027 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1138  glycosyltransferase, group 2 family protein  32.54 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 401 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1403  glycosyl transferase family 2  39.61 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0691788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2456  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 432 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.130133  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0835  glycosyl transferase family 2  31.81 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.445477  hitchhiker  0.00049802 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1378  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.19 
 
 		 396 aa  163  6e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  34.96 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1811  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0837  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.15 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 		 397 aa  139  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1009  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.411292  normal  0.902987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  28.46 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1434  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.52 
 
 		 396 aa  103  8e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 435 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3708  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.497307  normal  0.144342 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3853  glycosyl transferase family 2  27.89 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  25.81 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 		 425 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3140  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2574  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  27.18 
 
 		 520 aa  96.7  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  25.81 
 
 		 433 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.18 
 
 		 505 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 		 495 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  26.07 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2715  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 395 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  26.07 
 
 		 433 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  25.96 
 
 		 422 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  25.45 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 421 aa  94.4  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  27.18 
 
 		 662 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 475 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 475 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 476 aa  93.2  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  26.2 
 
 		 497 aa  92  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  23.86 
 
 		 433 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  26.64 
 
 		 633 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 		 509 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  21.55 
 
 		 433 aa  87  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 520 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 520 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 520 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 546 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  26.94 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 		 494 aa  85.9  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 393 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4794  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2905  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 395 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  24.85 
 
 		 469 aa  84  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  24.19 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 471 aa  83.2  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 509 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3861  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0793444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0166  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.84 
 
 		 513 aa  82  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  24.05 
 
 		 767 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 		 509 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  27.71 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 		 678 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  25.9 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  27.64 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  25.49 
 
 		 806 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  26.65 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  22.37 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 604 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  26.69 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  25.18 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  25.1 
 
 		 636 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.26 
 
 		 549 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 684 aa  74.3  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0166  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  24.64 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  24.65 
 
 		 628 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  22.48 
 
 		 656 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  23.24 
 
 		 615 aa  73.6  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1657  glycosyl transferase family 2  24.04 
 
 		 732 aa  73.6  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0588308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 		 596 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>