More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4704 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
483 aa  965    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  53.81 
 
 
471 aa  387  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 
476 aa  213  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  37.97 
 
 
633 aa  192  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  37.57 
 
 
505 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
399 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  37.57 
 
 
662 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  37.57 
 
 
520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  39.49 
 
 
520 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  39.49 
 
 
520 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  39.49 
 
 
520 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 
446 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 
475 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  36.69 
 
 
475 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  35.69 
 
 
476 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 
473 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  31.63 
 
 
458 aa  153  7e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  39.19 
 
 
439 aa  152  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  37.35 
 
 
502 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  37.77 
 
 
443 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
438 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
438 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  38.46 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  30.08 
 
 
469 aa  140  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
468 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.31 
 
 
1115 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  30.13 
 
 
1118 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.56 
 
 
1115 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
1101 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.31 
 
 
927 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.31 
 
 
1115 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.31 
 
 
1119 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  30.5 
 
 
433 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  28.89 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  24.81 
 
 
872 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  29.21 
 
 
433 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  29.21 
 
 
433 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3032  glycosyl transferase family 2  34.27 
 
 
627 aa  128  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.696996  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  28.89 
 
 
433 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  29.21 
 
 
433 aa  127  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
433 aa  127  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.06 
 
 
1115 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  30.16 
 
 
1124 aa  126  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
433 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
546 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
1002 aa  125  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  30.9 
 
 
433 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.76 
 
 
752 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  37.99 
 
 
422 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
420 aa  124  4e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18491  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
433 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.468741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 
508 aa  123  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  34.46 
 
 
806 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  31.15 
 
 
1099 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
509 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 
501 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17851  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0015  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
684 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
501 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18681  glycosyl transferase family protein  31.77 
 
 
433 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
393 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.04 
 
 
767 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  29.54 
 
 
686 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  26.14 
 
 
435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
433 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  29.47 
 
 
512 aa  113  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  31.87 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  35.53 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  31.93 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  35.53 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  28.44 
 
 
424 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  33.91 
 
 
418 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  24.02 
 
 
490 aa  111  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  30.77 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  30.77 
 
 
425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 
1120 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  31.46 
 
 
505 aa  110  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
495 aa  110  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  36.78 
 
 
678 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  32.71 
 
 
612 aa  109  1e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  32.68 
 
 
1154 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
616 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
683 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  32.03 
 
 
636 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
654 aa  107  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
604 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 
425 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 
494 aa  106  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 
789 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  30.14 
 
 
417 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 
789 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  28.82 
 
 
789 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
395 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
801 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>