More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0472 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 365 aa  731    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  49.44 
 
 		 362 aa  353  2e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  58.36 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  48.51 
 
 		 364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0523  glycosyl transferase family protein  57.79 
 
 		 356 aa  326  5e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.343071 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  35.5 
 
 		 387 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 		 378 aa  125  9e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  36.99 
 
 		 420 aa  122  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 		 403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 		 801 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 802 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  33.77 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 421 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 1101 aa  102  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  31.14 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  33.62 
 
 		 752 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  27.44 
 
 		 376 aa  98.6  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  31.62 
 
 		 1124 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 495 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 393 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  32.05 
 
 		 497 aa  92.4  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 388 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 509 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  35.82 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 		 533 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  28.44 
 
 		 395 aa  91.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 509 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 509 aa  90.9  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 520 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  26.95 
 
 		 398 aa  90.5  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 520 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 520 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  31.52 
 
 		 379 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.53 
 
 		 380 aa  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  28.16 
 
 		 478 aa  89.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 		 494 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.96 
 
 		 505 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  29.96 
 
 		 520 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.47 
 
 		 927 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  28.83 
 
 		 855 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  29.96 
 
 		 662 aa  87.4  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.96 
 
 		 633 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 476 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  25 
 
 		 399 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  25 
 
 		 399 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27 
 
 		 789 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27 
 
 		 789 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27 
 
 		 789 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 371 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 		 505 aa  87  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 402 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  26.05 
 
 		 872 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  25.63 
 
 		 390 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  26.61 
 
 		 403 aa  86.3  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  31.88 
 
 		 1099 aa  86.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  26.79 
 
 		 869 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 		 380 aa  85.9  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  29.43 
 
 		 739 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.66 
 
 		 379 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  24.35 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  26.33 
 
 		 869 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  31.31 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 1120 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  25.24 
 
 		 379 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  27.07 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 501 aa  83.2  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.05 
 
 		 1119 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.14 
 
 		 412 aa  82.8  0.000000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.68 
 
 		 1115 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.05 
 
 		 1115 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  28.1 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.05 
 
 		 1115 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  29.73 
 
 		 851 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  28.21 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  25.94 
 
 		 758 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  34.36 
 
 		 637 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.57 
 
 		 461 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.88 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>