More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3416 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
789 aa  1613    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
789 aa  1613    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
789 aa  1613    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.56 
 
 
1115 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  36.01 
 
 
1119 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  35.52 
 
 
872 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.43 
 
 
927 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 
1115 aa  431  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.29 
 
 
1115 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.59 
 
 
1115 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  36.92 
 
 
1124 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  35.35 
 
 
1101 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
1002 aa  349  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.52 
 
 
752 aa  348  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  34.97 
 
 
1118 aa  346  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  33.24 
 
 
1154 aa  326  9e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.22 
 
 
1099 aa  304  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  31.33 
 
 
1120 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
549 aa  191  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 
509 aa  181  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  34.58 
 
 
428 aa  172  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  27.99 
 
 
464 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  29.02 
 
 
403 aa  155  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  28.96 
 
 
464 aa  153  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  34.35 
 
 
461 aa  152  2e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
494 aa  149  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  35.06 
 
 
422 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  33.64 
 
 
410 aa  148  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  33.44 
 
 
433 aa  147  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  32.07 
 
 
479 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
425 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  31.87 
 
 
479 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  30 
 
 
411 aa  144  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
445 aa  142  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  33.81 
 
 
423 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  33.81 
 
 
423 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
429 aa  140  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  33.45 
 
 
423 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  33.45 
 
 
423 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  33.45 
 
 
423 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  33.45 
 
 
423 aa  140  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  32.43 
 
 
497 aa  140  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  35.6 
 
 
418 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  33.45 
 
 
423 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  30.33 
 
 
425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  30.33 
 
 
425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 
470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
495 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  36.13 
 
 
421 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  28.61 
 
 
399 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  28.38 
 
 
412 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  25.67 
 
 
399 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  25.67 
 
 
399 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  36.13 
 
 
421 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  31.37 
 
 
694 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 
479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
472 aa  132  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  35.71 
 
 
421 aa  132  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.46 
 
 
251 aa  132  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  27.49 
 
 
441 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
441 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  27.49 
 
 
441 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  28.12 
 
 
412 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  27.49 
 
 
441 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  27.49 
 
 
441 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
1184 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  31.2 
 
 
424 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
466 aa  128  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
469 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  33.86 
 
 
451 aa  127  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  31.19 
 
 
442 aa  128  5e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
477 aa  127  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  32.69 
 
 
442 aa  127  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  32.5 
 
 
418 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 
466 aa  126  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
475 aa  125  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  33.98 
 
 
417 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.33 
 
 
505 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  30.33 
 
 
662 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
275 aa  122  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  30.13 
 
 
412 aa  121  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2254  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
486 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
476 aa  121  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.95 
 
 
275 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  30.09 
 
 
520 aa  120  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.31 
 
 
275 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  29.74 
 
 
444 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  37.95 
 
 
305 aa  120  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
509 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  29.74 
 
 
444 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  29.74 
 
 
444 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
509 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  28.21 
 
 
442 aa  120  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.11 
 
 
275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1815  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 
467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  35.48 
 
 
275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.5 
 
 
405 aa  118  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>