More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3023 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
1120 aa  2272    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  36.17 
 
 
1124 aa  616  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.61 
 
 
1115 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  32.61 
 
 
1115 aa  594  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
1115 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  32.52 
 
 
1119 aa  592  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.27 
 
 
1115 aa  588  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.4 
 
 
927 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  34.93 
 
 
1101 aa  573  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 
1118 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  33.11 
 
 
1154 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  36.8 
 
 
872 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  32.25 
 
 
1002 aa  499  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  36.85 
 
 
752 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.55 
 
 
1099 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 
789 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 
789 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 
789 aa  290  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  39.84 
 
 
637 aa  241  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 
549 aa  197  7e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  35.39 
 
 
509 aa  197  8.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 
428 aa  158  7e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  39.66 
 
 
421 aa  153  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  39.24 
 
 
421 aa  153  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  39.66 
 
 
421 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  34.33 
 
 
403 aa  151  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  36.96 
 
 
422 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  40.49 
 
 
204 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  36.29 
 
 
424 aa  150  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  34.28 
 
 
425 aa  148  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  34.28 
 
 
425 aa  148  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  38.14 
 
 
251 aa  148  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  36.78 
 
 
442 aa  147  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  36.64 
 
 
461 aa  146  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  35.4 
 
 
444 aa  146  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  35.4 
 
 
444 aa  146  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  35.4 
 
 
444 aa  146  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
464 aa  146  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  37.02 
 
 
410 aa  146  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  35.54 
 
 
442 aa  144  9e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  33.7 
 
 
412 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  33.7 
 
 
412 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  35.83 
 
 
441 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 
441 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  35.83 
 
 
441 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  35.83 
 
 
441 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  32.48 
 
 
418 aa  143  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  35.83 
 
 
441 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  32.8 
 
 
423 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
479 aa  141  6e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
425 aa  141  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  35.42 
 
 
694 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  29.08 
 
 
411 aa  140  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  28.22 
 
 
399 aa  139  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  28.22 
 
 
399 aa  139  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  31.99 
 
 
433 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
479 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
479 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  37.07 
 
 
451 aa  139  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
483 aa  139  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  39.9 
 
 
305 aa  138  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  34.07 
 
 
429 aa  138  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5401  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
413 aa  137  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  33.69 
 
 
423 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
464 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  30.48 
 
 
417 aa  137  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  33.69 
 
 
423 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  36.4 
 
 
497 aa  136  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  32.97 
 
 
423 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  28.07 
 
 
412 aa  135  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
264 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
494 aa  134  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
495 aa  134  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  32.26 
 
 
423 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  32.26 
 
 
423 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  32.26 
 
 
423 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 
476 aa  134  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  27.32 
 
 
442 aa  133  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  36.97 
 
 
220 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  36.97 
 
 
213 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3637  polysaccharide deacetylase, putative  36.49 
 
 
244 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3642  putative polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
509 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
509 aa  129  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  32.33 
 
 
418 aa  129  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  36.49 
 
 
241 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  37.44 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  31.49 
 
 
662 aa  128  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.02 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  31.71 
 
 
633 aa  127  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  34.92 
 
 
481 aa  127  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  35.77 
 
 
505 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  35.77 
 
 
520 aa  127  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  37.32 
 
 
372 aa  127  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 
520 aa  127  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>