More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0584 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 481 aa  958    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  58.33 
 
 		 512 aa  535  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7084  glycosyl transferase family 2  54.87 
 
 		 483 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0202  putative glycosyltransferase  54.07 
 
 		 483 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 470 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.71 
 
 		 472 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 469 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  28.41 
 
 		 464 aa  150  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 477 aa  143  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 479 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 		 475 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  36.3 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2254  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  34.92 
 
 		 1120 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.78 
 
 		 1115 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.07 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1815  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.2 
 
 		 1115 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.2 
 
 		 927 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.2 
 
 		 1115 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.2 
 
 		 1119 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2253  glycosyl transferase family 2  23.37 
 
 		 498 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 		 1184 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.29 
 
 		 1115 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.58 
 
 		 752 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  33.46 
 
 		 1118 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  31.56 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.47 
 
 		 872 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 1154 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  31.86 
 
 		 1099 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  29.71 
 
 		 411 aa  111  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.72 
 
 		 1101 aa  110  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.05 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 789 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 789 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  29.05 
 
 		 789 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 1124 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 1002 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 		 549 aa  98.2  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 		 429 aa  95.9  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 		 637 aa  94.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 		 410 aa  92.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 632 aa  92  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  26.65 
 
 		 450 aa  90.5  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  26.08 
 
 		 461 aa  88.2  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 399 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  26.06 
 
 		 442 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  25.92 
 
 		 442 aa  86.7  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  25.92 
 
 		 442 aa  86.7  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  28.8 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  26.17 
 
 		 452 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 445 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  25.21 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  28.05 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  28.05 
 
 		 399 aa  84  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4179  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.83 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  28.17 
 
 		 437 aa  83.2  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  25.71 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  29.07 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  27.72 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  29.07 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  27.72 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  27.37 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  27.72 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  27.72 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  27.72 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  27.72 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  26.05 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  27.72 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  24.31 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  26.93 
 
 		 468 aa  80.1  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  24.91 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  24.91 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  30.5 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  28.99 
 
 		 421 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  24.91 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  25.67 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  23.26 
 
 		 694 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3648  hypothetical protein  27.08 
 
 		 365 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  28.19 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  26.59 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0464  glycosyl transferase family 2  31.49 
 
 		 631 aa  78.2  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>