More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2293 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  79.2 
 
 		 399 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  100 
 
 		 412 aa  846    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  79.2 
 
 		 399 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  38.69 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  38.44 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  38.2 
 
 		 421 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  38.98 
 
 		 418 aa  333  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  39.66 
 
 		 417 aa  332  5e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  40.19 
 
 		 444 aa  332  8e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  40.19 
 
 		 444 aa  332  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  40.19 
 
 		 444 aa  332  8e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  38.55 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  38.55 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  38.55 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  38.55 
 
 		 412 aa  329  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  38.55 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  38.55 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  39.86 
 
 		 442 aa  329  4e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  39.42 
 
 		 418 aa  330  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  38.8 
 
 		 412 aa  329  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  39.37 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  41.43 
 
 		 410 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  40.05 
 
 		 451 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  39.86 
 
 		 433 aa  323  5e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  37.71 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  37.08 
 
 		 425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  37.08 
 
 		 425 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  36.59 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  36.59 
 
 		 423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  36.59 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  35.85 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  35.85 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  35.85 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  35.77 
 
 		 423 aa  299  7e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  31.94 
 
 		 422 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 		 425 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  30.86 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 		 443 aa  190  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  29.6 
 
 		 442 aa  186  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  29.15 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 1002 aa  142  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.28 
 
 		 1099 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 		 479 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 		 752 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 		 479 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  33.48 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.04 
 
 		 872 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  32.75 
 
 		 1120 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  32.88 
 
 		 403 aa  133  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 450 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  29.45 
 
 		 927 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.82 
 
 		 1115 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 464 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.73 
 
 		 1115 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  29.45 
 
 		 1115 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  29.71 
 
 		 1119 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  28 
 
 		 1124 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.21 
 
 		 422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 470 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.73 
 
 		 1115 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 		 445 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 1184 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 		 466 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  28.89 
 
 		 1101 aa  123  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  31.86 
 
 		 1154 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 789 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.93 
 
 		 411 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 789 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 		 789 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 637 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 		 549 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  28.16 
 
 		 437 aa  119  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 1118 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  23.78 
 
 		 424 aa  117  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 		 395 aa  117  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 		 509 aa  116  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 		 472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  30.53 
 
 		 694 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 495 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 		 483 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 477 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 420 aa  112  9e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  24.3 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2254  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  25.07 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 		 450 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  24.51 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  25.07 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  24.37 
 
 		 662 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  25.07 
 
 		 475 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.51 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  26.1 
 
 		 475 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 509 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2253  glycosyl transferase family 2  25.06 
 
 		 498 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>