More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4287 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  100 
 
 		 442 aa  905    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  73.02 
 
 		 444 aa  666    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  73.02 
 
 		 444 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  73.02 
 
 		 444 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  95.02 
 
 		 442 aa  868    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  64.77 
 
 		 451 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  63.57 
 
 		 441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  63.57 
 
 		 441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  63.57 
 
 		 441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  63.57 
 
 		 441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  63.57 
 
 		 441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  64.89 
 
 		 412 aa  555  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  64.89 
 
 		 412 aa  554  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  55.8 
 
 		 418 aa  478  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  56.93 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  53.01 
 
 		 418 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  53.04 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  52.9 
 
 		 421 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  52.55 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  50 
 
 		 424 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  49.16 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  49.16 
 
 		 425 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  50.12 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  48.54 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  49.02 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  49.02 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  49.27 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  49.02 
 
 		 423 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  49.27 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  48.78 
 
 		 423 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  46.54 
 
 		 410 aa  349  6e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  39.71 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  41.73 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  41.73 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  39.66 
 
 		 429 aa  296  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  38.58 
 
 		 422 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  31.62 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  37.4 
 
 		 752 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  37.34 
 
 		 1099 aa  159  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  35.8 
 
 		 428 aa  156  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  36.78 
 
 		 1120 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  36.75 
 
 		 637 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 1124 aa  139  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.95 
 
 		 1101 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.27 
 
 		 549 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.56 
 
 		 1115 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  34.17 
 
 		 461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  31.18 
 
 		 1154 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  31.82 
 
 		 403 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 464 aa  129  8.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.99 
 
 		 927 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.36 
 
 		 1115 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 1002 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.36 
 
 		 872 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  27.99 
 
 		 1115 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  27.99 
 
 		 1119 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.36 
 
 		 1115 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 789 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 789 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  32.69 
 
 		 789 aa  126  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 395 aa  126  8.000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 1118 aa  123  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  28.2 
 
 		 445 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  26.03 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 479 aa  119  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.69 
 
 		 509 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 483 aa  117  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  34.06 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  26.01 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  31.08 
 
 		 694 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  25.14 
 
 		 437 aa  113  6e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 475 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  28.65 
 
 		 485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 485 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 435 aa  110  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 470 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 484 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  23.9 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  27.3 
 
 		 466 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 509 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 379 aa  103  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  25.59 
 
 		 425 aa  103  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  28.34 
 
 		 633 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  29.3 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.3 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  27.3 
 
 		 662 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  23.68 
 
 		 478 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>