More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19050 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  100 
 
 		 411 aa  817    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  46.97 
 
 		 403 aa  360  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  47.06 
 
 		 428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  33.43 
 
 		 1119 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  33.43 
 
 		 927 aa  186  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.42 
 
 		 1115 aa  186  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.43 
 
 		 1115 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  33.06 
 
 		 1115 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 		 1124 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 1115 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 1118 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  32.69 
 
 		 872 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 		 1101 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 1002 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  33.76 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  40.33 
 
 		 752 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  32.89 
 
 		 1099 aa  156  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  35.98 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 		 637 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 789 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 789 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 789 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  27.02 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  27.02 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  35.61 
 
 		 549 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  27.2 
 
 		 424 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  29.08 
 
 		 1120 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.66 
 
 		 1154 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 		 466 aa  126  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 420 aa  126  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 		 464 aa  125  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  31.14 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  30.18 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  29.58 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  33.77 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  28.15 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  28.15 
 
 		 399 aa  123  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  27.93 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  29.52 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  30.58 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 395 aa  120  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  31.12 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  26.03 
 
 		 442 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  29.84 
 
 		 412 aa  120  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  29.84 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  28.82 
 
 		 497 aa  119  7e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  29.84 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  29.84 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  29.84 
 
 		 441 aa  119  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  29.84 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 475 aa  119  7.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  24.93 
 
 		 442 aa  119  9e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  30.49 
 
 		 410 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 479 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  31.3 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  32.15 
 
 		 495 aa  117  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 		 479 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  30.64 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  30.64 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  30.64 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  27.92 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  30.87 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 		 479 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  30.43 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  30.43 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  30.87 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  30.43 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  36.24 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 484 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 464 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  29.57 
 
 		 423 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.4 
 
 		 505 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  26.39 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  30.4 
 
 		 662 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  23.12 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  30.34 
 
 		 520 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 481 aa  111  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  30.47 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  28.81 
 
 		 694 aa  110  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  30.46 
 
 		 633 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 477 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  27.43 
 
 		 1184 aa  106  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.12 
 
 		 472 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  29.96 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 		 509 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  25.12 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6271  glycosyl transferase family 2  30.88 
 
 		 658 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.449119 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>