More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1593 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
425 aa  872    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  65.44 
 
 
429 aa  553  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  38.72 
 
 
451 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  36.24 
 
 
442 aa  296  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  37.29 
 
 
418 aa  294  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  39.05 
 
 
421 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  38.92 
 
 
433 aa  293  4e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  35.76 
 
 
442 aa  293  5e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  38.56 
 
 
418 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  36.25 
 
 
417 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  37.12 
 
 
444 aa  289  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  37.12 
 
 
444 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  37.12 
 
 
444 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  39.05 
 
 
421 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  39.05 
 
 
421 aa  289  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  37.63 
 
 
422 aa  280  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  35.75 
 
 
412 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  35.75 
 
 
412 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  35.75 
 
 
441 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  35.75 
 
 
441 aa  277  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  35.75 
 
 
441 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  35.75 
 
 
441 aa  277  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  35.75 
 
 
441 aa  277  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  31.08 
 
 
424 aa  251  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  30.99 
 
 
425 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  30.99 
 
 
425 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  32.06 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  32.23 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  32.23 
 
 
423 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  32.99 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  32.99 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  34.79 
 
 
410 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  32.99 
 
 
423 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  32.23 
 
 
423 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  30.84 
 
 
412 aa  223  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  31.6 
 
 
399 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  31.6 
 
 
399 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  32.62 
 
 
442 aa  190  5e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
443 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  36.33 
 
 
752 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  39.39 
 
 
1124 aa  154  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 
1154 aa  153  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  33.56 
 
 
1101 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  34.31 
 
 
1099 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
789 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
789 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
789 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  36.8 
 
 
428 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.05 
 
 
1115 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  32.12 
 
 
1002 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  32.72 
 
 
403 aa  141  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  35.66 
 
 
1120 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.79 
 
 
872 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  34.14 
 
 
1118 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.44 
 
 
927 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.17 
 
 
1119 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 
509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.02 
 
 
1115 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.44 
 
 
1115 aa  137  4e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
549 aa  136  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  35.53 
 
 
637 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.91 
 
 
1115 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  36.68 
 
 
466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  32.93 
 
 
461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
445 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  23.8 
 
 
464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
450 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  30.33 
 
 
411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  30.86 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
466 aa  110  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
495 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
479 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
469 aa  107  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
632 aa  106  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 
445 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 
475 aa  105  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
479 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  24.21 
 
 
435 aa  104  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
479 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4173  putative beta-(1-3)-glucosyl transferase, ndvB-like protein  26.09 
 
 
895 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761366  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
476 aa  103  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  27.96 
 
 
433 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
446 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
484 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
433 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  23.71 
 
 
694 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  25.78 
 
 
480 aa  101  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
435 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
464 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
502 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  28.19 
 
 
483 aa  99.8  8e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.77 
 
 
505 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
475 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
475 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  28.8 
 
 
433 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  32.77 
 
 
520 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  28.27 
 
 
433 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  28.87 
 
 
469 aa  98.6  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  32.77 
 
 
662 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>