More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2253 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2254  glycosyl transferase family 2  62.63 
 
 		 486 aa  664    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2253  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 498 aa  1034    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3921  glycosyl transferase family protein  44.11 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2189  glycosyl transferase family 2  35.32 
 
 		 470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2362  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 		 469 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2439  glycosyl transferase family protein  34.3 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0463  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 1184 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 		 464 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.54 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1815  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 		 467 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3677  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 		 479 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3612  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 		 479 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0273319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3521  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 479 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1569  glycosyl transferase family 2  33.4 
 
 		 475 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1132  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 		 466 aa  262  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.311899  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2753  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 475 aa  260  4e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0274  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 484 aa  232  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1548  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.21 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4104  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.43 
 
 		 1115 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  23.22 
 
 		 1115 aa  126  9e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.01 
 
 		 1115 aa  126  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.22 
 
 		 1115 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  23.65 
 
 		 872 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.01 
 
 		 927 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.44 
 
 		 1119 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  23.32 
 
 		 752 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 1002 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7084  glycosyl transferase family 2  24.83 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  23.37 
 
 		 481 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  21.7 
 
 		 1124 aa  117  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  23.71 
 
 		 1099 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  23.41 
 
 		 789 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  23.41 
 
 		 789 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  23.41 
 
 		 789 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.27 
 
 		 1101 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.27 
 
 		 403 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0202  putative glycosyltransferase  24.83 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  26.57 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  23.73 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 		 637 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.33 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  25 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  25 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  20.9 
 
 		 1154 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  22.35 
 
 		 1120 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  21.59 
 
 		 1118 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  23.09 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  24.69 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  23.54 
 
 		 461 aa  93.6  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000617  glycosyltransferase  24.63 
 
 		 424 aa  93.2  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.786644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  23.77 
 
 		 442 aa  90.1  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  23.16 
 
 		 442 aa  90.1  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  24.37 
 
 		 442 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3373  glycosyl transferase family protein  24.4 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 		 509 aa  89  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4179  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.61 
 
 		 403 aa  88.2  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  22.79 
 
 		 425 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  22.79 
 
 		 425 aa  88.6  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  24.16 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  23.92 
 
 		 444 aa  87  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  23.92 
 
 		 444 aa  87  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  23.92 
 
 		 444 aa  87  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04326  N-glycosyltransferase  25.31 
 
 		 417 aa  87  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  24.68 
 
 		 451 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  24.4 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  24.4 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  23.37 
 
 		 425 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  24.4 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  24.67 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  24.4 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  24.4 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  24.67 
 
 		 412 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  23.06 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  23.19 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  23.81 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  22.85 
 
 		 497 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0677  putative glycosyl transferase  23.06 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0533389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  22.71 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  22.71 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  22.87 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  22.87 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  21.14 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  21.93 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  23.8 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  24.59 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  22.44 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  22.31 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  22.31 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  22.31 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  23.12 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  21.82 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0448  glycosyl transferase family protein  23.41 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  21.97 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  24.07 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  20.98 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  21.85 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  22.55 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>