224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_28550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_28550  glycosyl transferase  100 
 
 		 449 aa  901    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00136572  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7281  hyaluronan synthase  60.58 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265868  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3194  Hyaluronan synthase  31.54 
 
 		 531 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000019768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1161  glycosyl transferase family 2  36.86 
 
 		 531 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231473  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02290  polysaccharide synthase, putative  28.43 
 
 		 449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4918  glycosyl transferase family 2  31.23 
 
 		 426 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3830  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7721  glycosyl transferase family protein  29.22 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.85 
 
 		 397 aa  125  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6186  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5038  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2252  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 		 414 aa  124  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 648 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4027  glycosyl transferase family 2  29.4 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  33.21 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  24.74 
 
 		 480 aa  94.4  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09069  polysaccharide synthase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02500)  24.94 
 
 		 441 aa  94  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  23.56 
 
 		 478 aa  93.2  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0358  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  28.09 
 
 		 1099 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  27 
 
 		 1101 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.92 
 
 		 461 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.87 
 
 		 752 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.69 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0791  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 		 454 aa  73.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  24.37 
 
 		 927 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  24.37 
 
 		 1115 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.01 
 
 		 1115 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  24.37 
 
 		 1119 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.62 
 
 		 1124 aa  70.5  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.37 
 
 		 1115 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  25.32 
 
 		 1120 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  30.89 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  24.22 
 
 		 872 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 637 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 1002 aa  67.8  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.9 
 
 		 1115 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.27 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  25.27 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  22.87 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  31.14 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  25.37 
 
 		 662 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  23.96 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 1118 aa  64.3  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 		 520 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  23.17 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  23.21 
 
 		 1154 aa  63.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  22.87 
 
 		 716 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  27.54 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.34 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  23.08 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  21.99 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 885 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  22.69 
 
 		 862 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  22.69 
 
 		 863 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  23.1 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  22.69 
 
 		 863 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  23.05 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  23.89 
 
 		 919 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  22.8 
 
 		 863 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  23.87 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  25.24 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  25.24 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 		 632 aa  57.4  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  25.24 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  24.85 
 
 		 395 aa  57  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  22.71 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  21.85 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0472996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  21.85 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  21.85 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  24.58 
 
 		 694 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  22.27 
 
 		 749 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 		 378 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2068  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 424 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.178305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 		 889 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  21.85 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  21.85 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  21.85 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  23.43 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 		 895 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  25.36 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 		 899 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  23.58 
 
 		 863 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  25.51 
 
 		 903 aa  53.9  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 772 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 		 944 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  22.91 
 
 		 399 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  22.91 
 
 		 399 aa  53.5  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  22.47 
 
 		 399 aa  53.5  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2938  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 		 332 aa  53.1  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>