269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7281 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7281  hyaluronan synthase  100 
 
 
426 aa  864    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265868  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28550  glycosyl transferase  61.54 
 
 
449 aa  511  1e-144  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00136572  normal  0.0940176 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3194  Hyaluronan synthase  32.86 
 
 
531 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000019768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1161  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
531 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.231473  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02290  polysaccharide synthase, putative  28.29 
 
 
449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2252  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.15 
 
 
397 aa  137  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3830  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
415 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4918  glycosyl transferase family 2  28.31 
 
 
426 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
648 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7721  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
445 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6186  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
426 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5038  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4027  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 
484 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
433 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  23.58 
 
 
478 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09069  polysaccharide synthase Cps1, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02500)  24.42 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745462  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  26.8 
 
 
480 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0358  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
458 aa  89  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  26.77 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  29.75 
 
 
1099 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.63 
 
 
1120 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  25.86 
 
 
752 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.22 
 
 
461 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.69 
 
 
1115 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.82 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  26.97 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
509 aa  73.6  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  22.41 
 
 
927 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.41 
 
 
1115 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.69 
 
 
1115 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  21.57 
 
 
872 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.27 
 
 
1124 aa  72.4  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  22.13 
 
 
1119 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2271  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4538  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3699  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.780358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3825  glycosyl transferase family protein  41.13 
 
 
319 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
319 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4914  glycosyl transferase family protein  35.39 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141789 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  25.84 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 
637 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  21.25 
 
 
1115 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  24.37 
 
 
1154 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.14 
 
 
1101 aa  66.2  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.56 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  26.45 
 
 
1118 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0791  glycosyl transferase family 2  22.5 
 
 
454 aa  63.9  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 
471 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
420 aa  63.2  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  24.33 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2129  N-glycosyltransferase  24.8 
 
 
444 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.772993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2143  N-glycosyltransferase  24.8 
 
 
444 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.382592  normal  0.0135691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2239  N-glycosyltransferase  24.8 
 
 
444 aa  62.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.423629  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
509 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
509 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.65 
 
 
1002 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1264  N-glycosyltransferase  25.09 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2574  N-glycosyltransferase  25.19 
 
 
412 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0472996 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01024  predicted glycosyl transferase  25.19 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2621  glycosyl transferase family 2  25.19 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.252252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1137  N-glycosyltransferase  25.19 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0308707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01031  hypothetical protein  25.19 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1142  N-glycosyltransferase  25.19 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
423 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  24.47 
 
 
410 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  24.68 
 
 
437 aa  59.3  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
549 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 
476 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  23.81 
 
 
393 aa  58.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.34 
 
 
505 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  22.49 
 
 
749 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
772 aa  57.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  26.34 
 
 
520 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  22.36 
 
 
445 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.02 
 
 
326 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2532  putative glycosyl transferase  29.51 
 
 
317 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
423 aa  57  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6543  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  21.84 
 
 
514 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000751744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3257  cellulose synthase (UDP-forming)  26.97 
 
 
624 aa  56.6  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.660262  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  20.71 
 
 
450 aa  57  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.19 
 
 
326 aa  57  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  27.27 
 
 
383 aa  56.6  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.09 
 
 
315 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  24.44 
 
 
716 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
378 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 
236 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1123  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 
315 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0764134 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
481 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  26.34 
 
 
662 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  25.11 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  25.45 
 
 
633 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  25.73 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
520 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1135  glycosyl transferase family protein  20.27 
 
 
862 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.67659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>