More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1977 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
380 aa  774    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  53.81 
 
 
385 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  42.11 
 
 
379 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  42.56 
 
 
378 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  38.81 
 
 
371 aa  237  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  40.99 
 
 
802 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
390 aa  216  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  38.26 
 
 
411 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  36.51 
 
 
376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  37.34 
 
 
402 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  38.17 
 
 
402 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  37.09 
 
 
402 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  37.09 
 
 
402 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  40.7 
 
 
801 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
395 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 
379 aa  202  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  33.51 
 
 
387 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  34.02 
 
 
379 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  33.86 
 
 
403 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.42 
 
 
379 aa  186  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.28 
 
 
390 aa  179  9e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
374 aa  178  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 
396 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
380 aa  171  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  34.91 
 
 
383 aa  168  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  30.03 
 
 
388 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
382 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
378 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  28.65 
 
 
394 aa  144  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 
393 aa  141  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
471 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
378 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  30.75 
 
 
402 aa  126  8.000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  32.82 
 
 
461 aa  122  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  29.51 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  32.31 
 
 
872 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  33.74 
 
 
927 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  30.95 
 
 
1119 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 
1115 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  27.39 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  30.95 
 
 
1115 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.74 
 
 
1115 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 
408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.2 
 
 
1115 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.2 
 
 
752 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  32.49 
 
 
1002 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
387 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30.39 
 
 
1101 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  26.16 
 
 
694 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  31.06 
 
 
422 aa  99.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  28.99 
 
 
403 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
549 aa  98.2  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  31.06 
 
 
1099 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
364 aa  96.7  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
428 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
410 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 
475 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  30.8 
 
 
509 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
495 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 
475 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
365 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  32.05 
 
 
476 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  35.93 
 
 
502 aa  90.5  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
468 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  34.73 
 
 
520 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  39.84 
 
 
633 aa  89.4  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
373 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
648 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  34.73 
 
 
505 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  34.73 
 
 
662 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  26.17 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  35.63 
 
 
362 aa  87  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  27.52 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  27.52 
 
 
399 aa  86.3  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
433 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 
399 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
520 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  38.98 
 
 
528 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 
637 aa  83.6  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  26.47 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  28.32 
 
 
421 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  28.32 
 
 
421 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
445 aa  82  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  27.02 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  29.58 
 
 
1154 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 
509 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  24.9 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  31.33 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  31.1 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 
789 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 
789 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  29.19 
 
 
789 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>