More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2295 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 509 aa  1031    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  48.85 
 
 		 698 aa  443  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  49.7 
 
 		 628 aa  437  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  49.11 
 
 		 604 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  49.3 
 
 		 636 aa  425  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  45.24 
 
 		 654 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  46.03 
 
 		 635 aa  384  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  42.97 
 
 		 642 aa  294  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 		 624 aa  290  5.0000000000000004e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  44.09 
 
 		 652 aa  286  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.47 
 
 		 630 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  40.14 
 
 		 464 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  40.14 
 
 		 464 aa  277  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  40.47 
 
 		 512 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  39.76 
 
 		 417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.09 
 
 		 573 aa  273  5.000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  41.85 
 
 		 612 aa  271  2e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  38.46 
 
 		 606 aa  271  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  36.29 
 
 		 626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 		 626 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  38.23 
 
 		 475 aa  269  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  43.24 
 
 		 476 aa  266  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  37.63 
 
 		 848 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  38.73 
 
 		 664 aa  256  5e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  41.16 
 
 		 537 aa  250  4e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  37.33 
 
 		 615 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  39.66 
 
 		 673 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  42.02 
 
 		 656 aa  248  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.42 
 
 		 532 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  38.22 
 
 		 678 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 		 632 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  37.43 
 
 		 664 aa  231  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  37.15 
 
 		 686 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  39.74 
 
 		 616 aa  229  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  39.17 
 
 		 678 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.57 
 
 		 656 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  36.7 
 
 		 492 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  39.78 
 
 		 596 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  39.42 
 
 		 614 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  38.3 
 
 		 683 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 		 650 aa  213  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 		 465 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 395 aa  127  5e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 420 aa  126  7e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  35.35 
 
 		 216 aa  120  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  37.24 
 
 		 219 aa  118  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  31.18 
 
 		 433 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  31.18 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  31.18 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  31.18 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  31.18 
 
 		 433 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  29.64 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  29.25 
 
 		 662 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  29.06 
 
 		 633 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  28.37 
 
 		 520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.13 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 520 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.19 
 
 		 644 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  29.62 
 
 		 399 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 		 549 aa  97.8  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  27.62 
 
 		 469 aa  96.7  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  28.61 
 
 		 431 aa  96.3  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  25.84 
 
 		 435 aa  95.9  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 476 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 473 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1831  glycosyltransferase  26.27 
 
 		 473 aa  90.1  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 		 546 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 		 502 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  31.33 
 
 		 458 aa  87.4  6e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 		 509 aa  87  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 		 905 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 492 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.76 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 		 446 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 		 944 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 899 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0383  glycosyl transferase family protein  28.21 
 
 		 443 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.138846  normal  0.0930893 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0370  glycosyl transferase family 2  28.42 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0460104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 425 aa  81.6  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 		 919 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 		 501 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 889 aa  80.9  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>