More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2341 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 388 aa  806    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  47.92 
 
 		 380 aa  373  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  30.42 
 
 		 379 aa  199  5e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 376 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 		 382 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 		 802 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.94 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 378 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 801 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 		 393 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 395 aa  143  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 		 379 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 385 aa  140  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  28.53 
 
 		 378 aa  136  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 402 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 402 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  24.94 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  26.58 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  23.76 
 
 		 383 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.21 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  21.56 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  22.31 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  22.28 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 446 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  33.01 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 		 364 aa  97.8  3e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  23.86 
 
 		 408 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 433 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 365 aa  92  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  36.22 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 		 476 aa  88.6  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.65 
 
 		 1115 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.71 
 
 		 1115 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.32 
 
 		 872 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  25.32 
 
 		 927 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  25.32 
 
 		 1119 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  25.81 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  25.32 
 
 		 1115 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.32 
 
 		 1115 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  27.43 
 
 		 458 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 475 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  30.95 
 
 		 520 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.95 
 
 		 505 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  30.95 
 
 		 662 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 520 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 509 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 549 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 509 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  30.16 
 
 		 633 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  33.64 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 502 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  26.88 
 
 		 422 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  24.11 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  29.82 
 
 		 1154 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.82 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  25.35 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  23.96 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25.22 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  25.27 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1099  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  31.62 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  24.91 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1474  glycosyltransferase  22.34 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  22.18 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  33.09 
 
 		 694 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 		 509 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  27.22 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  25.86 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  24.26 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 1120 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 1101 aa  68.6  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  24.26 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>