More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2214 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
371 aa  736    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  56.99 
 
 
379 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  54.07 
 
 
410 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.81 
 
 
380 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 
385 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 
411 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  37.73 
 
 
421 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
395 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
374 aa  192  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
379 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  37.66 
 
 
379 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 
390 aa  190  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  34.97 
 
 
802 aa  189  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
402 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  38.44 
 
 
378 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  35.17 
 
 
801 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
402 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
402 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  34.43 
 
 
402 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 
376 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 
393 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  38.02 
 
 
382 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 
390 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  37.84 
 
 
383 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 
396 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  31.32 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
380 aa  162  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
393 aa  155  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
378 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.38 
 
 
379 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
388 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
387 aa  142  7e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
378 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  30.92 
 
 
398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  29.91 
 
 
395 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
471 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  32.3 
 
 
402 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
408 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  27.24 
 
 
394 aa  115  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 
351 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
362 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
373 aa  96.7  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 
752 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  32.51 
 
 
433 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  27.72 
 
 
480 aa  91.3  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  30.3 
 
 
403 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  40.77 
 
 
1101 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
428 aa  86.7  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
365 aa  86.3  7e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  28.02 
 
 
478 aa  85.9  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  33.14 
 
 
505 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  36.07 
 
 
1099 aa  83.6  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
789 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
789 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  33.14 
 
 
520 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
789 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  33.14 
 
 
662 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 
475 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
374 aa  82  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  33.33 
 
 
461 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  33.14 
 
 
633 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.33 
 
 
549 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  25.79 
 
 
694 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
520 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
520 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
520 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 
399 aa  77  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
528 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  38.28 
 
 
502 aa  76.3  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 
494 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  34.75 
 
 
1115 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  34.65 
 
 
1119 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.72 
 
 
509 aa  75.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.75 
 
 
1115 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  33.59 
 
 
927 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 
648 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.59 
 
 
1115 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  32.81 
 
 
872 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  33.9 
 
 
1115 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 
1124 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
637 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
505 aa  72.8  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
483 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 
642 aa  71.2  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 
1118 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 
495 aa  70.5  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  34.15 
 
 
1154 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  29.56 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 
330 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>