195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3877 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
393 aa  794    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  35.66 
 
 
374 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
402 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.15 
 
 
390 aa  179  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 
379 aa  179  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
402 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
402 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  31.98 
 
 
402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
390 aa  166  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  28.61 
 
 
395 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
393 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
421 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
379 aa  156  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
371 aa  155  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 
379 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
378 aa  146  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  32.31 
 
 
378 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
411 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
801 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  31.67 
 
 
383 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.93 
 
 
380 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  26.06 
 
 
387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  23.8 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
802 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  24.04 
 
 
380 aa  125  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
385 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
376 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
403 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  28.03 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  26.76 
 
 
395 aa  114  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.38 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
471 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
402 aa  103  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  21.56 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
351 aa  85.9  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.52 
 
 
1099 aa  83.2  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.9 
 
 
752 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  24 
 
 
376 aa  80.5  0.00000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.91 
 
 
1118 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  25.82 
 
 
1101 aa  77.4  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.66 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  23.61 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
433 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 
428 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 
509 aa  68.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  25.23 
 
 
1124 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0087  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
374 aa  66.2  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
387 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  25.96 
 
 
637 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  26.17 
 
 
445 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  21.85 
 
 
418 aa  63.2  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.36 
 
 
1120 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  23.49 
 
 
423 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  23.32 
 
 
411 aa  62.8  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  22.86 
 
 
442 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0484  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 
301 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
1002 aa  61.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  21.86 
 
 
442 aa  60.5  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  24.65 
 
 
421 aa  60.5  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.93 
 
 
789 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.93 
 
 
789 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.93 
 
 
789 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4179  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.6 
 
 
403 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3535  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
442 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0420  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  23.75 
 
 
421 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  22.33 
 
 
442 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  22.58 
 
 
422 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  23.71 
 
 
423 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  23.71 
 
 
423 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.89 
 
 
1115 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.38 
 
 
927 aa  57.4  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  21.64 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  23.29 
 
 
423 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  24.7 
 
 
360 aa  57.4  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  23.29 
 
 
423 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  23.29 
 
 
423 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0735  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 
441 aa  57  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  22.89 
 
 
872 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  23.38 
 
 
1115 aa  57  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.38 
 
 
1119 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.38 
 
 
1115 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  24.07 
 
 
421 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.65 
 
 
1115 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
549 aa  55.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  23.71 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
471 aa  55.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  21.9 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.14 
 
 
1154 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 
443 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.22 
 
 
461 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  21.52 
 
 
485 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  21.52 
 
 
485 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  23.02 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  21.52 
 
 
485 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>