More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003542 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  100 
 
 		 395 aa  821    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  74.37 
 
 		 398 aa  617  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  50.13 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  30.62 
 
 		 402 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  30.75 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.61 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 396 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 374 aa  166  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 378 aa  156  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 801 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 379 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  25.38 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 382 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 		 421 aa  138  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  28.41 
 
 		 802 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 385 aa  127  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 471 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.13 
 
 		 379 aa  123  7e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  24.16 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  27.68 
 
 		 383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.53 
 
 		 380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 		 402 aa  116  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 351 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  27.79 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 		 388 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 365 aa  96.3  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 362 aa  93.6  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.68 
 
 		 1154 aa  93.2  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  27.64 
 
 		 752 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 789 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 789 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.33 
 
 		 789 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  25.09 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.01 
 
 		 1115 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  25.83 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  25.83 
 
 		 399 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  21.79 
 
 		 495 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  22.83 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.26 
 
 		 422 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  25.59 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  23.73 
 
 		 1115 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.45 
 
 		 927 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  23.37 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  22.74 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.45 
 
 		 1115 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.51 
 
 		 1119 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  23.08 
 
 		 872 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.45 
 
 		 1115 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0288  N-glycosyltransferase  23.1 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.393224  normal  0.0606217 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3764  N-glycosyltransferase  22.02 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 		 509 aa  73.2  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4841  N-glycosyltransferase  22.02 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  23.69 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 356 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.56 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  23.05 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  23.05 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  23.36 
 
 		 1099 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  22.73 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  23.46 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  23.2 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3421  N-glycosyltransferase  22.08 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.543844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24 
 
 		 1101 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4264  N-glycosyltransferase  22.08 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.219891  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  24.06 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4102  N-glycosyltransferase  22.08 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0468214  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  23.26 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  24.41 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  26.34 
 
 		 707 aa  67.8  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  23.67 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  24.7 
 
 		 1120 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2079  glycosyl transferase family 2  22.25 
 
 		 401 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.959735 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  25.14 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1852  glycosyl transferase family 2  23.48 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2790  N-glycosyltransferase  21.95 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.347496  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  22.95 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>