More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2373 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 411 aa  826    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  79.51 
 
 		 421 aa  653    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  56.64 
 
 		 395 aa  441  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  36.91 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  37.88 
 
 		 379 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 		 393 aa  232  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.37 
 
 		 390 aa  216  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 		 396 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 		 371 aa  210  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  34.86 
 
 		 403 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.26 
 
 		 380 aa  205  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  36.05 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  38.32 
 
 		 802 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  34.99 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 374 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  36.58 
 
 		 801 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  39.37 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 		 376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 378 aa  162  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  29.87 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  33.5 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  33.08 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  37 
 
 		 471 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.76 
 
 		 379 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  28.71 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 393 aa  143  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  29.83 
 
 		 395 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  28.18 
 
 		 398 aa  136  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0567  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.33 
 
 		 461 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  29.97 
 
 		 1101 aa  98.6  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 362 aa  97.1  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 637 aa  93.2  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 351 aa  93.2  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  32.85 
 
 		 752 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  30.97 
 
 		 1099 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 364 aa  87  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  32.41 
 
 		 662 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.62 
 
 		 505 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  28.29 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  32.41 
 
 		 520 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  32.87 
 
 		 633 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2535  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  30.87 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.95 
 
 		 1115 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  27.55 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  29.69 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.15 
 
 		 1124 aa  80.5  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  29.72 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  27.88 
 
 		 1115 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  28.99 
 
 		 872 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  27.43 
 
 		 927 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.99 
 
 		 1115 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.99 
 
 		 1119 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  29.86 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  29.86 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  27.07 
 
 		 694 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.99 
 
 		 1115 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 		 520 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  24.93 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 509 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  25.67 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 		 1002 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  28.3 
 
 		 1118 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 		 502 aa  73.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  22.83 
 
 		 403 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0179  N-glycosyltransferase  26.02 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.574055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 230 aa  72.4  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.8 
 
 		 1120 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  25.56 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  25.16 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.3 
 
 		 789 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>