141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1027 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
408 aa  848    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  43.23 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  36.11 
 
 
396 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  35.01 
 
 
390 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 
393 aa  221  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.97 
 
 
390 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
395 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
402 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
374 aa  150  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
379 aa  146  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 
421 aa  143  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 
801 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
411 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
802 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  27.99 
 
 
378 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  26.33 
 
 
385 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  27.17 
 
 
371 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.62 
 
 
380 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  27.05 
 
 
398 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 
379 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 
378 aa  104  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
379 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
378 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  26.38 
 
 
383 aa  102  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  23.57 
 
 
394 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  24.86 
 
 
395 aa  100  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  25.59 
 
 
376 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  26.1 
 
 
380 aa  99.8  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 
471 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  23.3 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
402 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.37 
 
 
379 aa  84  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  21.54 
 
 
387 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  23.25 
 
 
393 aa  76.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  23.67 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  24.56 
 
 
872 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  24.2 
 
 
927 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 
365 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  22.91 
 
 
1115 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  24.2 
 
 
1119 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 
1154 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  24.2 
 
 
1115 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  26.87 
 
 
1101 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
364 aa  66.2  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
483 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.49 
 
 
1115 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  23.62 
 
 
428 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
752 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.78 
 
 
1115 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 
648 aa  61.2  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 
789 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 
789 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  24.6 
 
 
789 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 
1002 aa  60.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4840  hyaluronan synthase  22.51 
 
 
478 aa  60.1  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55692  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  21.66 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  23.74 
 
 
768 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
420 aa  57.4  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10838  putative glycosyltransferase  22.14 
 
 
480 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0787082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
450 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.2 
 
 
1099 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  22.57 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  24 
 
 
328 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
433 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  25.59 
 
 
549 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
637 aa  53.5  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  25.82 
 
 
458 aa  53.1  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1457  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
356 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.7433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  23.92 
 
 
528 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
322 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
362 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  24.76 
 
 
1120 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  24.17 
 
 
461 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  24.7 
 
 
495 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 
362 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  20.89 
 
 
387 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  23.56 
 
 
473 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4949  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
446 aa  50.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.816666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  20.78 
 
 
475 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  20.78 
 
 
475 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  23.47 
 
 
439 aa  49.7  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  22.89 
 
 
411 aa  49.7  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22610  glycosyl transferase  23.53 
 
 
497 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.634128  normal  0.441487 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0523  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.343071 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  22.71 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  20.2 
 
 
403 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  25.24 
 
 
633 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  22.47 
 
 
471 aa  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
425 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  23.19 
 
 
423 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  22.75 
 
 
423 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  22.75 
 
 
423 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 
433 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 
494 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>