More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0160 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0160  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 
379 aa  770    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2330  glycosyl transferase family protein  47.71 
 
 
376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  42.82 
 
 
378 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2008  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
379 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1777  glycosyl transferase family 2  36.39 
 
 
802 aa  196  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1977  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.42 
 
 
380 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2470  glycosyl transferase family 2  40.55 
 
 
801 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1655  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
385 aa  188  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2016  glycosyl transferase family protein  33 
 
 
402 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323936  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5020  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.14 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3399  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
379 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0186  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0851797  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3705  glycosyl transferase family 2  32.49 
 
 
396 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.806401  normal  0.251051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2214  glycosyl transferase family 2  31.38 
 
 
371 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3075  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
374 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3862  glycosyl transferase family 2  31.12 
 
 
403 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
380 aa  166  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2031  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
393 aa  165  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000685673 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1811  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000206288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2373  glycosyl transferase family protein  33.76 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2119  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
402 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000829457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2049  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
402 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.695075  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3105  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
421 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359614  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3583  glycosyl transferase family protein  31.76 
 
 
395 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0096  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 
382 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.86731 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1844  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
387 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0681  glycosyl transferase family 2  29.92 
 
 
379 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.923916 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  28.65 
 
 
383 aa  136  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
378 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3877  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 
393 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.148656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2341  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3389  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 
378 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3063  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198233  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003542  putative intercellular adhesion protein A  24.93 
 
 
395 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02219  hypothetical protein  24.31 
 
 
398 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0296  putative transmembrane glycosyl transferase  25.94 
 
 
394 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.617548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0785  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
402 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.546497  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
365 aa  95.1  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1027  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 
408 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0362  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.279909  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
362 aa  86.7  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  30.56 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
433 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  28.12 
 
 
694 aa  80.1  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  38.52 
 
 
1099 aa  80.1  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  29.88 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  28.02 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0930  glycosyl transferase family protein  33.13 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.569667  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 
509 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  27.01 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  23.31 
 
 
1101 aa  69.7  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  25.97 
 
 
752 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0149  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.15168  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
502 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 
359 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
494 aa  68.2  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
505 aa  67.8  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  27.54 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  34.16 
 
 
259 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  30.29 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  30.29 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1608  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
373 aa  65.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  24.77 
 
 
872 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
302 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2981  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 
387 aa  63.9  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.65 
 
 
927 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  35.65 
 
 
1115 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  35.65 
 
 
1119 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.65 
 
 
1115 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 
789 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 
789 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  25.44 
 
 
789 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.78 
 
 
1115 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1764  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.09 
 
 
864 aa  63.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.91993  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  26.67 
 
 
490 aa  63.2  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
226 aa  62.8  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  34.78 
 
 
1115 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
235 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
227 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 
648 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  34.35 
 
 
345 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
235 aa  61.6  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  34.19 
 
 
1118 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  30.3 
 
 
495 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  32.23 
 
 
442 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
485 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
443 aa  60.5  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
485 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  25.9 
 
 
485 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
425 aa  60.1  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  27.43 
 
 
666 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
632 aa  60.1  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1272  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
494 aa  60.1  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102707  normal  0.130658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  25.27 
 
 
468 aa  59.7  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 
380 aa  59.7  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
414 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
1002 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>