More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1040 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 380 aa  781    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  42.02 
 
 		 359 aa  287  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  37.31 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2182  b-glycosyltransferase  32.47 
 
 		 379 aa  202  9e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.935401  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04930  putative transmembrane glycosyltransferase  31.55 
 
 		 371 aa  152  8.999999999999999e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.74238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 		 343 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  28.8 
 
 		 461 aa  96.3  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  26.38 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07871  hypothetical protein  26.05 
 
 		 364 aa  88.6  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6919  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 408 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1431  glycosyl transferase family 2  26.99 
 
 		 376 aa  86.3  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.679301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3358  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 		 389 aa  85.9  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  28.32 
 
 		 694 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  25.82 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 1101 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  26.92 
 
 		 1099 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  31.9 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 789 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 789 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 789 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4080  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.606735  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 		 509 aa  77.8  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.14 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.51 
 
 		 528 aa  77  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  23.06 
 
 		 365 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  29.2 
 
 		 1124 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 		 1115 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.92 
 
 		 1120 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  26.69 
 
 		 927 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.92 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  25.74 
 
 		 1115 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  26.69 
 
 		 1115 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  26.69 
 
 		 1115 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  30.28 
 
 		 1118 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  25.85 
 
 		 872 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  26.69 
 
 		 1119 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 		 445 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1532  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.196809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  22.3 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2827  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  27.62 
 
 		 479 aa  69.7  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.98 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2915  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2075  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 		 253 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.13 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2546  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0135584  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0112  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.37 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  33.83 
 
 		 792 aa  67  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 328 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 225 aa  67  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 328 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  28.18 
 
 		 479 aa  66.6  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1375  glycosyl transferase family 2  24.34 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  23.88 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 549 aa  66.2  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 313 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 		 362 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  24.16 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 238 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 		 1002 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  26.33 
 
 		 707 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 312 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0690  putative glucosyl transferase  22.35 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  41.07 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  24.78 
 
 		 362 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 326 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  23.87 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  28.37 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  25.7 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  26.62 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.72 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  23.95 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  26.78 
 
 		 1154 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.553625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>