More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3671 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
300 aa  607  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  41.84 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  32.05 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 
305 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 
297 aa  129  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
321 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
328 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
328 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
305 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
528 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
305 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 
322 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2989  family 2 glycosyl transferase  32.9 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3930  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
413 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.555455  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.01 
 
 
337 aa  86.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0434  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
460 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
325 aa  84.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5590  glycosyl transferase family 2  32.88 
 
 
328 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.399759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
477 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.31 
 
 
2401 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0428  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3250  glycosyl transferase family 2  30.04 
 
 
307 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4588  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.151626  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  29.24 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
454 aa  75.5  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  34.53 
 
 
792 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
753 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  29.96 
 
 
312 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2680  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
426 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1586  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.807446  normal  0.639173 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2904  glycosyl transferase family protein  34.97 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000158295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.88 
 
 
403 aa  71.6  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  23.83 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4681  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627848  normal  0.36467 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1479  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.35 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0517693  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
314 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  28.27 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2618  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.19 
 
 
326 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21170  glycosyl transferase  40.77 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2480  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.19 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10111  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3392  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0548  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.14 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2241  glycosyl transferase family 2, involved in cell wall biogenesis  31.34 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0118567  normal  0.43942 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  30.81 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 
841 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
1275 aa  69.3  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
344 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
470 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1960  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
310 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  35.04 
 
 
1162 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0760  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
303 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  24.79 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1842  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 
884 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0913  putative glycosyltransferase  38.98 
 
 
1066 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193043  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
335 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  30.48 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
324 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4447  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133329  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 
289 aa  67.4  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
1739 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  23.26 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  43.33 
 
 
1168 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2949  glycosyl transferase family 2  26.38 
 
 
392 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
328 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26650  predicted glycosyltransferase  32.51 
 
 
474 aa  67  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.755615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  37.9 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5551  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3728  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.703441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>