More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0635 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0635  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 310 aa  634    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0689  glycosyl transferase family protein  83.17 
 
 		 312 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0464  glycosyl transferase  82.85 
 
 		 310 aa  534  1e-151  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1793  glycosyl transferase family 2  82.41 
 
 		 313 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.237379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2203  glycosyl transferase family 2  82.85 
 
 		 315 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0605  glycosyl transferase  77.02 
 
 		 310 aa  507  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1671  glycosyl transferase family 2  77.99 
 
 		 310 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000135664  normal  0.123031 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0404  glycosyl transferase family 2  51.27 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0210127 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0228  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.27 
 
 		 320 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.421511  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1551  glycosyl transferase family 2  47.94 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000748201  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  48.24 
 
 		 319 aa  306  3e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1041  glycosyl transferase family 2  49.68 
 
 		 368 aa  298  6e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0061  glycosyl transferase family 2  47.59 
 
 		 336 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3397  glycosyl transferase family protein  47.6 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17011  glycosyl transferase family protein  45.78 
 
 		 320 aa  285  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.553457  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1989  glycosyl transferase family protein  46.3 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0339  glycosyl transferase family protein  45.98 
 
 		 320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0298954 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4198  glycosyl transferase family protein  47.88 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.797946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2657  family 2 glycosyl transferase  47.44 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.759475  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17141  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 		 320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.517229  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17261  glycosyl transferase family protein  45.78 
 
 		 320 aa  281  9e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503177  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23431  glycosyl transferase family protein  44.81 
 
 		 342 aa  280  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0955  glycosyl transferase family 2  44.94 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3622  glycosyl transferase family protein  45.95 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00095064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4237  glycosyl transferase family 2  47.1 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.796008  hitchhiker  0.0000633175 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3095  glycosyl transferase family 2  45.08 
 
 		 341 aa  278  9e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16431  glycosyl transferase family protein  44.98 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.713365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0403  glycosyl transferase family 2  44.3 
 
 		 343 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4382  glycosyl transferase family 2  48.08 
 
 		 336 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2754  glycosyl transferase family 2  47.3 
 
 		 318 aa  275  8e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.412494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4444  glycosyl transferase family 2  47.76 
 
 		 336 aa  275  9e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1106  glycosyl transferase family 2  46.2 
 
 		 338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.263485  normal  0.233647 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1087  glycosyltransferase  44.81 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19621  glycosyl transferase family protein  44.48 
 
 		 320 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.217021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0656  glycosyl transferase family protein  44.86 
 
 		 329 aa  271  8.000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3480  glycosyl transferase family protein  45.98 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.324933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0411  glycosyl transferase family protein  43.29 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2892  glycosyl transferase family protein  46.65 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0153758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1005  glycosyl transferase family protein  42.9 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  45.13 
 
 		 324 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3450  glycosyl transferase family 2  44.84 
 
 		 314 aa  266  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3516  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000921398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1772  putative glycosyltransferase transmembrane protein  43.41 
 
 		 347 aa  265  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2585  glycosyl transferase family protein  45.69 
 
 		 316 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6420  glycosyl transferase family 2  49.51 
 
 		 333 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.880852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0623  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.37 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.517222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3834  glycosyl transferase family protein  43.13 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0445  glycosyl transferase family 2  41.85 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4095  glycosyl transferase family protein  44.59 
 
 		 335 aa  255  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.864702  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0359  glycosyl transferase family protein  41.8 
 
 		 568 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143693  normal  0.385412 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1411  glycosyltransferase transmembrane protein  43.26 
 
 		 302 aa  248  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  40.85 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4415  glycosyl transferase family protein  42.49 
 
 		 339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0760  glycosyl transferase family protein  45.34 
 
 		 343 aa  238  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.057751 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  39.81 
 
 		 332 aa  236  3e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2286  glycosyl transferase family protein  36.74 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.398997  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  36.28 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3181  glycosyl transferase family 2  36.05 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3117  glycosyl transferase family 2  34.81 
 
 		 315 aa  218  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5120  glycosyl transferase family 2  35.76 
 
 		 323 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  40.06 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1442  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.66 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  40.2 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2281  glycosyl transferase family 2  39.87 
 
 		 337 aa  205  8e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0390263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  37.69 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11238  putative glycosyltransferase  34.32 
 
 		 317 aa  204  2e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 318 aa  202  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2410  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 		 331 aa  202  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.488157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1880  glycosyl transferase family 2  35.11 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00309208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1792  b-glycosyltransferase  34.07 
 
 		 324 aa  189  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.794906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3690  glycosyl transferase family 2  43.56 
 
 		 234 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.349905  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3770  b-glycosyltransferase  37.27 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1832  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.5 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  33.87 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2611  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  34.19 
 
 		 327 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3151  glycosyl transferase family 2  40.71 
 
 		 243 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0539097  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2145  glycosyl transferase family 2  41.07 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0368252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2690  glycosyl transferase family protein  33.44 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125609  normal  0.620007 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1174  glycosyl transferase family protein  39.11 
 
 		 240 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.59 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1596  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.44 
 
 		 240 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4016  glycosyl transferase family 2  31.95 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.322981  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.27 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  32.27 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  32.27 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3696  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.785719  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.27 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.27 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.59 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.59 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.59 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.59 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>