165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3358 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3358  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
389 aa  806    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515299  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4080  glycosyl transferase family 2  45.9 
 
 
401 aa  345  7e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.606735  normal  0.10978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6919  glycosyl transferase family 2  39.79 
 
 
408 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  44.79 
 
 
368 aa  266  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1431  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 
376 aa  252  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.679301 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07871  hypothetical protein  35.01 
 
 
364 aa  219  7e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  44.44 
 
 
349 aa  208  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
384 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
359 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  23.46 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1379  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04930  putative transmembrane glycosyltransferase  26.2 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.74238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  22.76 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2182  b-glycosyltransferase  24.71 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.935401  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  23.19 
 
 
461 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
322 aa  59.3  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  33.9 
 
 
309 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  31.03 
 
 
792 aa  58.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2212  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 
648 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  34.38 
 
 
401 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
322 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  21.19 
 
 
445 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  24.27 
 
 
443 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  24.17 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
402 aa  54.7  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4643  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
485 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4731  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
485 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5026  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
485 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  29.46 
 
 
332 aa  52.8  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1980  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
323 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 
256 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5156  family 2 glycosyl transferase  26.4 
 
 
216 aa  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 
397 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  22.35 
 
 
304 aa  51.2  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
349 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0212  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
331 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.921554  normal  0.557032 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 
346 aa  50.8  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  28.87 
 
 
927 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
328 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
375 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
328 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0663  hypothetical protein  25.53 
 
 
376 aa  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1593  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.901855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  27.84 
 
 
872 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  28.87 
 
 
1115 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  28.87 
 
 
1119 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  28.28 
 
 
391 aa  49.7  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.87 
 
 
1115 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0452  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 
464 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.87 
 
 
1115 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  29.84 
 
 
403 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
1156 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  24.86 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1454  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1965  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
286 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000341692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3216  glycosyl transferase family 2  23.12 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3404  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0673516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  25.83 
 
 
238 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
331 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  32.98 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  29 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1158  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
324 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.1 
 
 
341 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  29 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  29 
 
 
327 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0111  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
318 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.375009  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.16 
 
 
376 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 
841 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3010  N-glycosyltransferase  27.62 
 
 
421 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  30.7 
 
 
422 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3924  family 2 glycosyl transferase  18.64 
 
 
419 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 
379 aa  47.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0427  family 2 glycosyl transferase  23.93 
 
 
388 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3117  N-glycosyltransferase  27.62 
 
 
421 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0949  glycosyltransferase  29.41 
 
 
442 aa  47  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.157522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
924 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  28 
 
 
327 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  29.27 
 
 
236 aa  46.6  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  23.89 
 
 
1099 aa  46.6  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2293  N-glycosyltransferase  28.71 
 
 
412 aa  46.6  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00369291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
395 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  29.17 
 
 
259 aa  46.2  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1716  glycosyl transferase family protein  30.21 
 
 
243 aa  46.2  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
328 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2925  N-glycosyltransferase  26.67 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26101  putative glycosyl transferase  23.88 
 
 
367 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 
337 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1815  glycosyl transferase family 2  24.26 
 
 
467 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 
335 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  24.86 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
383 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>